细胞Hi-C检测

信息概要

细胞Hi-C检测是一种基于高通量测序技术的三维基因组学分析方法，用于研究染色质在细胞核内的空间构象与相互作用。该技术通过捕获染色体片段之间的物理邻近关系，揭示基因组的三维结构特征，为研究基因调控、染色体动态变化及疾病发生机制提供重要依据。检测的重要性在于能够解析基因组的空间组织对细胞功能的影响，助力基础科研、疾病诊断及药物开发。

检测项目

• 染色质三维结构解析
• 染色质相互作用频率分析
• 拓扑关联域（TAD）边界鉴定
• 启动子-增强子相互作用网络构建
• 染色体区室（Compartment）划分
• 长程染色质环检测
• 基因组空间距离矩阵生成
• 单倍型特异性三维结构分析
• 跨物种染色质构象比较
• 疾病相关染色质构象变异筛查
• 细胞分化过程中的三维动态变化追踪
• 核内染色体定位研究
• 基因共表达与空间邻近性关联分析
• 表观遗传修饰与三维结构的关联研究
• 转座酶可及性染色质区域（ATAC-HiC）整合分析
• 多组学数据（RNA-seq、ChIP-seq）联合分析
• 染色质环稳定性评估
• 核小体定位与三维结构的关联分析
• 转录因子结合位点的空间聚集性检测
• 重复序列在三维基因组中的分布研究

检测范围

• 动物细胞Hi-C检测
• 植物细胞Hi-C检测
• 人类原代细胞Hi-C检测
• 肿瘤细胞系Hi-C检测
• 干细胞Hi-C检测
• 胚胎发育不同阶段细胞Hi-C检测
• 神经细胞Hi-C检测
• 免疫细胞Hi-C检测
• 原核生物染色质构象检测
• 真核微生物Hi-C检测
• 病毒整合宿主基因组的三维结构分析
• 器官类器官Hi-C检测
• 冷冻保存细胞Hi-C检测
• 单细胞Hi-C检测
• 病理组织切片Hi-C检测
• 转基因模型细胞Hi-C检测
• 表观遗传编辑后细胞Hi-C分析
• 药物处理细胞三维结构变化检测
• 衰老细胞Hi-C检测
• 空间转录组联合Hi-C检测

检测方法

• 原位Hi-C技术（固定染色质原位酶切连接）
• DNase Hi-C（基于染色质可及性的高分辨率方法）
• 单细胞Hi-C（单细胞水平三维基因组分析）
• Capture Hi-C（靶向特定基因组区域）
• HiChIP（整合Hi-C与ChIP-seq的相互作用分析）
• Micro-C（微球菌核酸酶消化的高分辨率方法）
• ChIA-PET（染色质相互作用分析-配对末端标签测序）
• 4C-seq（环状染色质构象捕获测序）
• 5C技术（多路荧光连接介导的扩增）
• ATAC-HiC（联合染色质开放性分析）
• Hi-C数据分析（基于标准化与聚类算法）
• 三维基因组可视化建模
• 多组学整合分析（Hi-C+RNA-seq+ATAC-seq）
• 染色质动态模拟（分子动力学建模）
• 互作网络拓扑结构分析

检测仪器

• 高通量测序仪（Illumina NovaSeq）
• 超声破碎仪
• 生物分析仪（Agilent 2100）
• 实时定量PCR仪
• 低温高速离心机
• 交联反应仪
• DNA片段化仪
• 自动化文库制备系统
• 荧光显微镜
• 凝胶成像系统
• 核酸定量仪（Nanodrop）
• 超低温冰箱
• 恒温摇床
• 磁珠分离仪
• 多功能酶标仪

了解中析

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