细胞RNA-seq检测
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信息概要
细胞RNA-seq检测是通过高通量测序技术对细胞中转录组进行全面分析的服务,能够揭示基因表达水平、剪接变异体、新转录本及非编码RNA等信息。该检测在基础研究、疾病机制解析、药物开发及精准医疗等领域具有重要价值,可帮助研究者深入理解细胞功能、病理状态及调控网络。
本检测服务涵盖从样本制备、文库构建、测序到数据分析的全流程,确保结果的高灵敏度和准确性。通过标准化操作流程和严格质控体系,为客户提供可靠的转录组数据支持,助力科学发现与转化应用。
检测项目
- 总RNA质量评估
- mRNA表达定量分析
- lncRNA鉴定与表达分析
- circRNA检测与注释
- 可变剪接事件分析
- 差异表达基因筛选
- 基因融合事件检测
- SNP/InDel突变分析
- 功能富集分析(GO/KEGG)
- 共表达网络构建
- 转录因子调控预测
- RNA编辑位点识别
- 新转录本预测
- 样本间相关性分析
- RNA异构体定量
- miRNA-mRNA互作分析
- 细胞类型特异性表达解析
- 时间序列动态表达模式分析
- 病原微生物RNA检测
- 单细胞转录组整合分析
检测范围
- 人类原代细胞
- 哺乳动物细胞系
- 植物细胞
- 干细胞与诱导多能干细胞
- 免疫细胞亚群
- 肿瘤细胞
- 神经细胞
- 微生物共培养细胞
- 类器官模型
- 胚胎发育细胞
- 血液系统细胞
- 上皮与间充质细胞
- 原核生物细胞
- 病毒感染的宿主细胞
- 药物处理细胞模型
- 基因编辑细胞株
- 衰老细胞模型
- 应激响应细胞
- 3D培养细胞
- 稀有细胞群体
检测方法
- Illumina双端测序法(高精度短读长测序)
- Nanopore单分子测序(长读长直接RNA测序)
- SMART-seq2(全长转录本扩增)
- Drop-seq(单细胞转录组捕获)
- Ribo-depletion(去除核糖体RNA)
- PolyA富集法(真核mRNA特异性捕获)
- 链特异性文库构建(保留链方向信息)
- UMI标记(消除PCR重复偏倚)
- qRT-PCR验证(目标基因表达确认)
- 生物信息学比对(参考基因组映射)
- PCA降维分析(样本异质性评估)
- WGCNA加权共表达网络分析
- DESeq2差异表达统计模型
- STAR拼接比对算法
- Cufflinks转录本组装
检测仪器
- Illumina NovaSeq 6000
- Thermo Fisher Ion S5 XL
- Oxford Nanopore GridION
- Agilent 4200 TapeStation
- Qubit 4.0荧光计
- Bioanalyzer 2100
- Covaris M220超声破碎仪
- PCR仪(Veriti Pro)
- Beckman Coulter Biomek自动化项目合作单位
- Nanodrop分光光度计
- 10x Genomics Chromium控制器
- Miltenyi gentleMACS解离仪
- Beckman超速离心机
- Fluidigm C1单细胞制备系统
- BD FACSAria细胞分选仪
了解中析