基因编辑脱靶检测

信息概要

基因编辑脱靶检测是评估基因编辑技术（如CRISPR-Cas9）在目标位点外是否产生 unintended edits 的关键服务。该检测通过高通量测序和生物信息学分析，全面筛查脱靶效应，确保基因编辑的安全性和准确性。脱靶检测对于科研、临床前研究及药物开发至关重要，可避免潜在遗传风险，提高基因编辑技术的可靠性。

检测项目

• 全基因组脱靶位点筛查
• 靶向区域深度测序分析
• 插入/缺失突变检测
• 单核苷酸变异（SNV）检测
• 结构变异（SV）分析
• 拷贝数变异（CNV）评估
• 同源重组修复事件检测
• 非同源末端连接（NHEJ）事件分析
• 低频突变检测（灵敏度≥0.1%）
• 编辑效率定量分析
• 多靶点交叉验证
• 潜在脱靶位点预测
• 脱靶位点功能影响评估
• 编辑细胞克隆稳定性监测
• 脱靶位点遗传毒性分析
• 脱靶相关基因表达变化
• 表观遗传修饰检测
• 线粒体DNA脱靶筛查
• 转录组-wide off-target 分析
• 脱靶位点体内验证

检测范围

• CRISPR-Cas9编辑系统
• CRISPR-Cas12a（Cpf1）编辑系统
• 碱基编辑（Base Editing）
• 先导编辑（Prime Editing）
• TALEN基因编辑
• ZFN基因编辑
• RNA编辑技术
• 体细胞基因编辑
• 生殖细胞基因编辑
• 干细胞基因编辑
• 类器官基因编辑
• 动物模型基因编辑
• 植物基因组编辑
• 微生物基因组编辑
• 多重基因编辑系统
• 条件性基因编辑
• 表观基因组编辑
• 线粒体基因组编辑
• 病毒载体介导的基因编辑
• 非病毒载体基因编辑

检测方法

• 全基因组测序（WGS）：高通量检测全基因组范围内的脱靶事件
• 靶向测序（Targeted Sequencing）：针对预测脱靶位点深度测序
• GUIDE-seq：通过双链断裂捕获鉴定脱靶位点
• CIRCLE-seq：体外全基因组脱靶检测技术
• Digenome-seq：基于基因组DNA切割的脱靶分析
• HTGTS（高通量基因组易位测序）：检测染色体结构变异
• BLESS：直接检测DNA双链断裂位点
• DISCOVER-Seq：基于DNA修复标记的脱靶检测
• VIVO：体内验证脱靶方法
• 单细胞测序：分析编辑细胞的异质性
• RNA-seq：检测基因表达异常变化
• ChIP-seq：评估表观遗传修饰异常
• 核型分析：检测染色体水平异常
• 数字PCR：定量低频脱靶事件
• Sanger测序：靶位点编辑效率验证

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
• Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR
• Agilent 4200 TapeStation
• Thermo Fisher QuantStudio 7 Pro
• 10x Genomics Chromium Controller
• Nanopore GridION
• Beckman Coulter Biomek i7
• PerkinElmer LabChip GX Touch
• BioAnalyzer 2100
• Thermo Fisher Fragment Analyzer
• Qiagen QIAcube
• Eppendorf Mastercycler X50

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