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中析检测

功能富集显著性实验

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咨询量:  
更新时间:2025-07-01  /
咨询工程师

信息概要

功能富集显著性实验是一种用于分析基因或蛋白质功能富集情况的生物信息学方法,广泛应用于基因组学、转录组学和蛋白质组学研究。该实验通过统计方法评估特定功能类别(如通路、生物过程或分子功能)在目标基因集中的富集程度,从而揭示潜在的生物学意义。

检测功能富集显著性对于理解生物数据至关重要。它能够帮助研究人员发现与特定表型或条件相关的关键功能模块,为疾病机制研究、药物靶点筛选和生物标志物开发提供重要依据。第三方检测机构通过标准化流程和技术,确保实验结果的准确性和可靠性,为科研和临床应用提供有力支持。

检测项目

  • 基因本体论(GO)富集分析
  • KEGG通路富集分析
  • Reactome通路富集分析
  • 蛋白相互作用网络分析
  • 转录因子结合位点富集分析
  • miRNA靶基因富集分析
  • 疾病相关基因富集分析
  • 代谢通路富集分析
  • 信号通路富集分析
  • 细胞组分富集分析
  • 分子功能富集分析
  • 生物过程富集分析
  • 保守结构域富集分析
  • 染色体区域富集分析
  • 表观遗传标记富集分析
  • 药物靶点富集分析
  • 毒性相关通路富集分析
  • 发育相关基因富集分析
  • 免疫相关通路富集分析
  • 神经生物学通路富集分析

检测范围

  • 人类基因组数据
  • 小鼠基因组数据
  • 大鼠基因组数据
  • 果蝇基因组数据
  • 线虫基因组数据
  • 酵母基因组数据
  • 斑马鱼基因组数据
  • 拟南芥基因组数据
  • 水稻基因组数据
  • 玉米基因组数据
  • 猪基因组数据
  • 牛基因组数据
  • 鸡基因组数据
  • 猕猴基因组数据
  • 细菌基因组数据
  • 病毒基因组数据
  • 古菌基因组数据
  • 真菌基因组数据
  • 藻类基因组数据
  • 寄生虫基因组数据

检测方法

  • 超几何检验 - 基于超几何分布的统计检验方法
  • Fisher准确检验 - 用于小样本数据的显著性检验
  • 卡方检验 - 比较观察值与期望值的差异
  • 基因集富集分析(GSEA) - 基于排序基因列表的方法
  • DAVID分析 - 综合功能注释工具
  • STRING分析 - 蛋白质相互作用网络分析
  • Cytoscape可视化 - 生物网络可视化分析
  • Metascape分析 - 多组学数据整合分析
  • Enrichr分析 - 在线基因集富集分析工具
  • GREAT分析 - 基因组区域富集分析
  • ToppGene分析 - 候选基因优先排序工具
  • g:Profiler分析 - 多功能富集分析工具
  • WebGestalt分析 - 网页版富集分析工具
  • clusterProfiler分析 - R语言富集分析包
  • PANTHER分析 - 基于蛋白质家族分类的系统

检测仪器

  • 高通量测序仪
  • 实时荧光定量PCR仪
  • 微阵列扫描仪
  • 质谱仪
  • 流式细胞仪
  • 荧光显微镜
  • 共聚焦显微镜
  • 超速离心机
  • 核酸蛋白检测仪
  • 凝胶成像系统
  • 电泳系统
  • 色谱系统
  • 生物分析仪
  • 细胞计数仪
  • 酶标仪

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