基因编辑效率检测

信息概要

基因编辑效率检测是评估基因编辑工具（如CRISPR-Cas9、TALENs等）在靶向修饰基因组时的有效性和准确性的关键步骤。该检测通过定量分析编辑后的基因序列，确定插入、缺失或替换等编辑事件的发生率，为科研和临床研究提供可靠的数据支持。基因编辑效率检测的重要性在于确保编辑工具的精准性，避免脱靶效应，并为后续实验或治疗方案的优化提供依据。

第三方检测机构提供的基因编辑效率检测服务涵盖多种技术平台和检测方法，可针对不同基因编辑工具和样本类型进行定制化分析。检测结果可用于验证编辑工具的效能、评估实验设计的合理性以及满足监管机构的合规要求。

检测项目

• 靶向编辑效率定量分析
• 插入突变检测
• 缺失突变检测
• 点突变检测
• 多等位基因编辑分析
• 脱靶效应评估
• 编辑位点覆盖率
• 编辑深度分析
• 嵌合体编辑检测
• 单细胞编辑效率分析
• 编辑位点测序验证
• 编辑产物的功能验证
• 编辑后基因表达水平检测
• 编辑后蛋白表达水平检测
• 编辑后细胞表型分析
• 编辑后基因组稳定性评估
• 编辑后细胞存活率检测
• 编辑后细胞增殖能力分析
• 编辑后细胞分化能力检测
• 编辑后免疫原性评估

检测范围

• CRISPR-Cas9编辑效率检测
• CRISPR-Cas12编辑效率检测
• TALENs编辑效率检测
• ZFNs编辑效率检测
• 碱基编辑效率检测
• Prime编辑效率检测
• RNA编辑效率检测
• 线粒体基因组编辑效率检测
• 植物基因组编辑效率检测
• 动物基因组编辑效率检测
• 人类细胞基因组编辑效率检测
• 微生物基因组编辑效率检测
• 原代细胞编辑效率检测
• 干细胞编辑效率检测
• 肿瘤细胞编辑效率检测
• 胚胎编辑效率检测
• 器官类编辑效率检测
• 病毒载体介导的编辑效率检测
• 非病毒载体介导的编辑效率检测
• 高通量编辑效率筛查

检测方法

• Sanger测序：通过测序分析编辑位点的序列变化
• 高通量测序（NGS）：大规模并行测序检测编辑效率和脱靶效应
• 数字PCR：精准定量编辑效率
• 实时荧光定量PCR（qPCR）：快速检测编辑产物的存在
• TA克隆测序：分离单克隆编辑产物进行测序验证
• 限制性片段长度多态性（RFLP）：通过酶切分析编辑位点
• 荧光原位杂交（FISH）：可视化编辑位点的分布
• 流式细胞术：检测编辑后细胞表型变化
• Western Blot：分析编辑后蛋白表达水平
• 免疫荧光染色：定位编辑后蛋白的表达位置
• 质谱分析：鉴定编辑后蛋白的修饰变化
• 单细胞测序：分析单细胞水平的编辑效率
• 微滴式数字PCR（ddPCR）：高灵敏度定量编辑效率
• 电泳分析：检测编辑后DNA片段大小变化
• Southern Blot：验证编辑后基因组结构变化

检测仪器

• Illumina测序仪
• ABI测序仪
• Nanopore测序仪
• 数字PCR仪
• 实时荧光定量PCR仪
• 流式细胞仪
• 电泳仪
• 凝胶成像系统
• 显微操作系统
• 质谱仪
• 荧光显微镜
• 超微量分光光度计
• 离心机
• 生物分析仪
• 细胞计数器

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