表观基因组测序

信息概要

表观基因组测序是一种通过分析DNA甲基化、组蛋白修饰等表观遗传标记来研究基因表达调控的高通量技术。该技术能够揭示环境、疾病或发育过程中基因调控的动态变化，为疾病机制研究、生物标志物发现和精准医疗提供重要依据。

表观基因组测序的重要性在于，它能够在不改变DNA序列的情况下，解析基因表达的调控机制，帮助科学家理解复杂疾病（如癌症、神经退行性疾病）的发生发展过程，并为个性化治疗提供潜在靶点。

本检测服务涵盖全基因组甲基化测序、单细胞表观组测序等多种技术，可满足科研和临床研究的不同需求，确保数据准确性和可靠性。

检测项目

• 全基因组DNA甲基化分析
• 启动子区甲基化水平检测
• 增强子区域甲基化状态
• CpG岛甲基化谱
• 单碱基分辨率甲基化检测
• 组蛋白H3K27me3修饰分析
• 组蛋白H3K4me3修饰分析
• 组蛋白H3K9me2修饰分析
• 染色质可及性检测
• 核小体定位分析
• DNA羟甲基化水平检测
• 等位基因特异性甲基化
• 差异甲基化区域鉴定
• 甲基化位点关联分析
• 表观遗传年龄预测
• 甲基化与基因表达关联分析
• 肿瘤特异性甲基化标志物筛查
• 环境暴露相关甲基化变化
• 发育阶段特异性甲基化模式
• 跨代表观遗传效应分析

检测范围

• 全基因组甲基化测序
• 简化代表性甲基化测序
• 靶向甲基化测序
• 单细胞甲基化测序
• 氧化亚硫酸盐测序
• 甲基化DNA免疫沉淀测序
• 染色质免疫沉淀测序
• ATAC-seq
• Hi-C
• DNase-seq
• MNase-seq
• FAIRE-seq
• ChIP-exo
• ChIA-PET
• RRBS
• WGBS
• scATAC-seq
• scChIP-seq
• 单核甲基化测序
• 空间表观组测序

检测方法

• 亚硫酸盐处理测序：通过亚硫酸盐转化未甲基化的胞嘧啶，实现甲基化位点检测
• MeDIP-seq：利用抗甲基化DNA抗体富集甲基化片段后进行测序
• MBD-seq：通过甲基化DNA结合蛋白捕获甲基化DNA片段
• RRBS：限制性酶切结合亚硫酸盐处理的甲基化检测方法
• ChIP-seq：通过特异性抗体富集特定组蛋白修饰的DNA片段
• ATAC-seq：检测染色质开放区域的高通量方法
• Hi-C：研究三维基因组结构和染色质互作的技术
• DNase-seq：通过DNase I酶切分析染色质可及性
• MNase-seq：通过微球菌核酸酶分析核小体定位
• FAIRE-seq：基于甲醛交联和片段化检测开放染色质
• 单细胞ATAC-seq：在单细胞水平分析染色质可及性
• 单细胞ChIP-seq：单细胞分辨率的组蛋白修饰检测
• oxBS-seq：区分5mC和5hmC的氧化亚硫酸盐测序
• TAB-seq：高分辨率检测5hmC的测序技术
• scCOOL-seq：单细胞多组学表观遗传分析技术

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• Illumina NextSeq 550
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• Bionano Saphyr
• 10x Genomics Chromium
• Fluidigm C1
• Bio-Rad ddSEQ
• Agilent 4200 TapeStation
• Qubit 4 Fluorometer
• Nanodrop One
• Covaris S220
• Bioruptor Pico
• Thermo Fisher QuantStudio