测序深度优化实验

信息概要

测序深度优化实验是一种通过调整测序覆盖深度以提高数据质量和准确性的技术手段。该产品主要用于基因组学、转录组学等领域的研究，能够有效降低测序错误率并提高变异检测的灵敏度。

检测的重要性在于，测序深度直接影响数据的可靠性和后续分析的准确性。通过优化测序深度，可以避免资源浪费，同时确保关键区域的高覆盖率，为科研和临床诊断提供可靠的数据支持。

本检测服务涵盖从样本制备到数据分析的全流程，提供的技术支持和定制化解决方案，满足不同研究需求。

检测项目

• 测序覆盖均匀性
• 目标区域覆盖率
• 平均测序深度
• GC含量偏差
• 重复序列比例
• 插入片段大小分布
• 碱基质量评分
• 比对率
• 重复比对率
• 变异检测灵敏度
• 变异检测特异性
• SNP检测准确性
• Indel检测准确性
• CNV检测性能
• SV检测性能
• 嵌合体检测率
• 测序错误率
• 文库复杂度
• 数据产出量
• 有效数据比例

检测范围

• 全基因组测序
• 全外显子组测序
• 目标区域测序
• RNA测序
• 单细胞测序
• 宏基因组测序
• 甲基化测序
• ChIP测序
• ATAC测序
• Hi-C测序
• 长读长测序
• 循环肿瘤DNA测序
• 微生物组测序
• 植物基因组测序
• 动物基因组测序
• 人类基因组测序
• 病原体基因组测序
• 古DNA测序
• 转录组测序
• 表观基因组测序

检测方法

• Illumina测序技术 - 基于边合成边测序原理的高通量测序方法
• PacBio SMRT测序 - 利用单分子实时测序技术获得长读长数据
• Oxford Nanopore测序 - 通过纳米孔检测DNA分子电信号变化
• qPCR定量 - 准确测定DNA或RNA的浓度和质量
• 生物分析仪检测 - 评估核酸片段大小分布和完整性
• 荧光定量法 - 快速测定文库浓度
• 杂交捕获技术 - 用于目标区域富集
• PCR扩增技术 - 用于文库制备和目标扩增
• 片段分析 - 评估插入片段大小分布
• 比对分析 - 将测序reads比对到参考基因组
• 变异检测算法 - 识别SNP、Indel等遗传变异
• 拷贝数变异分析 - 检测基因组拷贝数变化
• 结构变异分析 - 识别大片段基因组重排
• RNA-seq分析 - 定量基因表达水平
• 甲基化分析 - 检测DNA甲基化状态

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• Qubit荧光定量仪
• Agilent 2100生物分析仪
• QuantStudio实时荧光定量PCR仪
• Covaris破碎仪
• Beckman Coulter Biomek自动化项目合作单位
• Thermo Fisher KingFisher核酸提取仪
• Bio-Rad CFX Connect实时PCR系统
• Agilent TapeStation
• Nanodrop分光光度计
• MiSeq测序仪
• NextSeq 550测序仪

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