微生物检测全基因组测序

信息概要

微生物检测全基因组测序是一种基于高通量测序技术的微生物基因组分析服务，通过对微生物样本的全基因组进行测序和分析，提供全面的基因组信息，包括物种鉴定、功能基因分析、耐药基因检测、毒力因子分析等。

该检测服务在食品安全、环境监测、临床诊断、生物制药等领域具有重要应用价值，能够帮助客户快速、准确地识别微生物种类，评估其潜在风险，并为后续研究和决策提供科学依据。

全基因组测序技术具有高分辨率、高灵敏度和高通量的特点，能够检测到传统方法难以发现的低丰度微生物和基因变异，为微生物研究提供了全新的视角和工具。

检测项目

• 微生物物种鉴定
• 基因组组装与注释
• 功能基因分析
• 耐药基因检测
• 毒力因子分析
• 代谢通路分析
• 基因组比较分析
• 单核苷酸多态性(SNP)分析
• 插入缺失(InDel)分析
• 结构变异(SV)分析
• 质粒检测与分析
• 噬菌体检测与分析
• 移动遗传元件分析
• 抗生素耐药性预测
• 毒力基因预测
• 环境适应性基因分析
• 生物膜形成相关基因检测
• 次级代谢产物合成基因簇分析
• CRISPR-Cas系统分析
• 系统发育分析

检测范围

• 细菌
• 真菌
• 病毒
• 古菌
• 支原体
• 衣原体
• 立克次体
• 螺旋体
• 放线菌
• 乳酸菌
• 大肠杆菌
• 金黄色葡萄球菌
• 沙门氏菌
• 李斯特菌
• 结核分支杆菌
• 铜绿假单胞菌
• 白色念珠菌
• 黑曲霉
• 酿酒酵母
• 噬菌体

检测方法

• DNA提取与纯化：采用优化的提取方法获取高质量基因组DNA
• 文库构建：使用片段化、末端修复、加A尾和接头连接等步骤制备测序文库
• Illumina测序：采用高通量短读长测序技术获取基因组数据
• Nanopore测序：利用长读长测序技术辅助基因组组装
• PacBio测序：提供高质量的长读长测序数据
• 宏基因组测序：对环境样本中的混合微生物群落进行测序分析
• 单细胞基因组测序：对单个微生物细胞进行基因组测序
• RNA测序：分析微生物转录组信息
• 甲基化测序：检测基因组甲基化修饰
• Hi-C测序：研究基因组三维结构
• ChIP-seq：分析蛋白质-DNA相互作用
• 宏转录组测序：研究微生物群落基因表达
• 全基因组重测序：对已知基因组进行深度测序
• de novo测序：对未知基因组进行从头测序
• 靶向测序：对特定基因组区域进行深度测序

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• Illumina MiSeq
• Oxford Nanopore MinION
• Oxford Nanopore GridION
• Oxford Nanopore PromethION
• PacBio Sequel II
• PacBio Sequel IIe
• Ion Torrent S5
• Ion Torrent PGM
• BGISEQ-500
• BGISEQ-50
• MGISEQ-2000
• MGISEQ-200
• Qubit荧光定量仪