植物长非编码RNA检测

信息概要

植物长非编码RNA（lncRNA）检测服务是针对植物基因组中长度超过200个核苷酸的非编码RNA分子进行系统性分析与鉴定的检测项目。通过对lncRNA的表达水平、序列特征、结构变异及其调控功能的研究，可为植物生长发育、逆境响应、表观遗传调控等研究提供关键数据支持。该检测对揭示植物复杂性状的分子机制、优化遗传育种策略以及开发新型生物技术产品具有重要意义。

检测项目

• lncRNA表达谱分析
• lncRNA序列全长鉴定
• lncRNA可变剪接分析
• lncRNA与靶基因共表达网络构建
• lncRNA二级结构预测
• lncRNA亚细胞定位分析
• lncRNA甲基化修饰检测
• lncRNA与蛋白质互作验证
• lncRNA保守性及进化分析
• lncRNA功能结构域预测
• lncRNA启动子活性分析
• lncRNA调控miRNA的ceRNA机制验证
• lncRNA在逆境胁迫下的动态表达
• lncRNA组织特异性分析
• lncRNA表观遗传修饰关联分析
• lncRNA转录起始位点验证
• lncRNA多聚腺苷酸化信号检测
• lncRNA与染色质互作分析（ChIRP）
• lncRNA功能缺失/增益实验设计
• lncRNA数据库比对与注释

检测范围

• 拟南芥
• 水稻
• 小麦
• 玉米
• 大豆
• 番茄
• 棉花
• 油菜
• 马铃薯
• 杨树
• 柑橘
• 苹果
• 高粱
• 甘蔗
• 烟草
• 莴苣
• 辣椒
• 黄瓜
• 葡萄
• 草莓

检测方法

• RNA测序（RNA-Seq）：高通量检测lncRNA表达及序列信息
• qRT-PCR：定量验证lncRNA表达水平
• Northern Blot：检测lncRNA分子大小及丰度
• RACE技术：获取lncRNA全长序列
• ChIRP-seq：解析lncRNA与染色质的互作位点
• RNA荧光原位杂交（FISH）：亚细胞定位分析
• RNA结构预测软件（如RNAfold）：预测二级结构
• CLIP-seq：研究lncRNA与RNA结合蛋白的相互作用
• 甲基化特异性PCR（MSP）：检测DNA甲基化修饰
• CRISPR/Cas9基因编辑：功能缺失实验验证
• 核质分离RNA测序：分析lncRNA分布特征
• 链特异性测序：区分正义与反义转录本
• ChIP-seq：关联lncRNA与组蛋白修饰
• 双荧光素酶报告系统：验证lncRNA调控功能
• 生物信息学分析：共表达网络及功能富集

检测仪器

• 高通量测序仪（Illumina NovaSeq）
• 实时荧光定量PCR仪（ABI QuantStudio）
• 核酸蛋白测定仪（Nanodrop）
• 凝胶成像系统（Bio-Rad ChemiDoc）
• 超速离心机（Beckman Coulter）
• 荧光显微镜（Zeiss Axio Imager）
• 核酸电泳系统（Bio-Rad PowerPac）
• 显微操作仪（Eppendorf TransferMan）
• 生物分析仪（Agilent 2100）
• 激光共聚焦显微镜（Leica TCS SP8）
• 低温高速离心机（Eppendorf 5430R）
• 紫外分光光度计（Thermo Scientific NanoDrop One）
• 核酸杂交炉（Hybaid Shake'n Stack）
• 基因扩增仪（Bio-Rad T100 Thermal Cycler）
• 多功能酶标仪（Tecan Infinite M200）

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