CRISPR编辑效率检测

信息概要

CRISPR编辑效率检测是基因编辑技术研究与应用中的关键环节，通过精准评估CRISPR系统对目标基因的编辑效果，确保实验的可靠性和可重复性。该检测服务由第三方机构提供，涵盖从基础研究到临床应用的全方位需求，帮助科研人员优化编辑策略、验证编辑结果，并为后续研究提供数据支持。

CRISPR编辑效率检测的重要性在于：一方面，它可以量化编辑成功率，避免脱靶效应导致的潜在风险；另一方面，它为基因功能研究、疾病模型构建及基因治疗开发提供了标准化评估手段。我们的检测服务采用国际认可的技术流程，确保数据准确性和性。

检测项目

• 靶向编辑位点测序覆盖率
• 插入/缺失突变（Indel）频率
• 同源定向修复（HDR）效率
• 脱靶效应检测深度
• 单细胞编辑异质性分析
• 多靶点协同编辑效率
• 基因敲除（KO）成功率
• 基因敲入（KI）整合率
• 大片段删除/重复检测
• 等位基因编辑偏向性
• 编辑位点甲基化状态
• 转录本水平编辑验证
• 蛋白质表达水平变化
• 细胞存活率与编辑相关性
• sgRNA活性评估
• Cas9蛋白活性检测
• 基因组结构变异分析
• 编辑克隆纯合度鉴定
• 线粒体DNA编辑效率
• 表观遗传修饰影响评估

检测范围

• 哺乳动物细胞系基因编辑
• 原代免疫细胞工程化改造
• 植物基因组定向修饰
• 微生物基因回路优化
• 类器官模型基因编辑
• 胚胎干细胞基因校正
• 肿瘤模型基因功能研究
• 遗传疾病基因治疗验证
• 转基因动物模型构建
• 农业性状改良品种检测
• 工业菌株代谢通路编辑
• 基因驱动系统效率评估
• 病毒载体基因组编辑
• 线粒体基因治疗检测
• 表观基因组编辑验证
• 多重基因编辑系统测试
• 合成生物学元件优化
• 基因电路功能验证
• CRISPR-Cas变体效率比较
• 碱基编辑系统精准度检测

检测方法

• 高通量测序（NGS）：深度解析编辑位点序列变异
• 数字PCR（dPCR）：绝对定量低频编辑事件
• T7E1错配切割实验：快速检测Indel形成
• Sanger测序：靶向位点编辑验证
• 流式细胞分选（FACS）：基于报告基因的编辑效率分析
• 数字微滴PCR（ddPCR）：高灵敏度编辑定量
• 全基因组测序（WGS）：系统性脱靶效应筛查
• 单细胞转录组测序（scRNA-seq）：编辑异质性研究
• 质谱分析：编辑后蛋白产物验证
• 荧光原位杂交（FISH）：大片段编辑可视化
• Southern blot：基因整合完整性检测
• 数字染色体构象捕获（Hi-C）：三维基因组影响评估
• 甲基化特异性PCR（MSP）：表观遗传修饰检测
• 微滴式单细胞基因组测序：克隆演化追踪
• CRISPResso2生物信息学分析：NGS数据化处理

检测仪器

• Illumina NovaSeq测序仪
• ABI 3730xl遗传分析仪
• Bio-Rad QX200微滴式数字PCR系统
• Nanopore GridION测序平台
• BD FACSAria III流式细胞分选仪
• Agilent 4200 TapeStation系统
• Thermo Fisher QuantStudio实时PCR仪
• 10x Genomics Chromium单细胞平台
• PacBio Sequel II长读长测序仪
• Beckman Coulter CytoFLEX流式细胞仪
• Oxford Nanopore PromethION设备
• Qiagen QIAcube核酸提取项目合作单位
• PerkinElmer LabChip GX Touch系统
• BioTek Synergy H1微孔板检测仪
• MGI DNBSEQ-G50便携式测序仪

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