可变剪接验证

信息概要

可变剪接验证是基因表达调控中的重要环节，通过检测可变剪接事件，可以深入理解基因功能的多样性和复杂性。第三方检测机构提供的可变剪接验证服务，能够准确识别和验证不同剪接异构体，为科研和临床研究提供可靠的数据支持。该检测服务在疾病机制研究、药物靶点发现以及个性化医疗等领域具有重要应用价值。

可变剪接验证的重要性在于，它能够揭示基因表达调控的精细机制，帮助研究者发现新的生物标志物或治疗靶点。通过高通量测序和生物信息学分析，该服务可全面覆盖基因组的可变剪接事件，确保数据的准确性和可重复性。

检测项目

• 剪接异构体鉴定
• 外显子跳跃检测
• 内含子保留分析
• 可变启动子使用
• 可变终止子使用
• 外显子互斥事件
• 剪接位点突变验证
• 剪接调控元件分析
• RNA编辑事件检测
• 剪接因子结合位点鉴定
• 剪接异构体定量
• 组织特异性剪接分析
• 疾病相关剪接事件筛查
• 剪接异构体功能预测
• 剪接调控网络构建
• 剪接与表观遗传关联分析
• 剪接异构体稳定性评估
• 剪接与翻译效率关联研究
• 剪接异构体亚细胞定位
• 剪接与蛋白质互作分析

检测范围

• 人类基因组
• 小鼠基因组
• 大鼠基因组
• 果蝇基因组
• 斑马鱼基因组
• 线虫基因组
• 酵母基因组
• 植物基因组
• 细菌基因组
• 病毒基因组
• 肿瘤组织样本
• 血液样本
• 脑组织样本
• 心脏组织样本
• 肝脏组织样本
• 肾脏组织样本
• 肺组织样本
• 肌肉组织样本
• 干细胞样本
• 原代细胞样本

检测方法

• RNA-seq测序：高通量测序技术检测转录本剪接变异
• qRT-PCR：定量验证特定剪接异构体的表达水平
• 纳米孔测序：长读长测序技术解析全长剪接异构体
• 微阵列分析：芯片技术检测已知剪接事件
• 单细胞RNA测序：在单细胞水平解析剪接异质性
• RACE：确定转录本5'和3'末端结构
• Northern blot：传统方法验证剪接异构体大小
• Western blot：检测蛋白质水平的剪接变异
• 质谱分析：鉴定剪接变异产生的蛋白质产物
• 荧光报告基因检测：评估剪接调控元件的功能
• EMSA：分析剪接因子与RNA的结合特性
• CLIP-seq：全基因组水平鉴定剪接因子结合位点
• Nanostring技术：数字定量检测剪接异构体
• ddPCR：超灵敏定量检测稀有剪接变异
• 原位杂交：空间定位剪接异构体的表达

检测仪器

• Illumina NovaSeq
• PacBio Sequel
• Oxford Nanopore GridION
• ABI QuantStudio
• Bio-Rad CFX
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Nanostring nCounter
• Bio-Rad QX200
• Thermo Fisher Orbitrap
• AB Sciex TripleTOF
• GE Typhoon
• Bio-Rad ChemiDoc
• Agilent SureScan
• PerkinElmer Vectra
• Beckman Coulter CytoFLEX

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