RNA-seq转录组分析

信息概要

RNA-seq转录组分析是一种基于高通量测序技术的基因表达研究方法，能够全面、准确地检测样本中所有转录本的表达水平。该技术广泛应用于基础研究、临床诊断、药物开发等领域，为基因功能研究、疾病机制探索和生物标志物发现提供了重要工具。

RNA-seq转录组分析的重要性在于其能够揭示基因表达的动态变化，帮助研究人员理解细胞在不同生理或病理状态下的调控机制。通过该技术，可以检测到新的转录本、可变剪切事件、基因融合以及非编码RNA等，为科学研究提供全面的数据支持。

我们的检测服务覆盖从样本制备到数据分析的全流程，确保数据的准确性和可靠性。我们拥有的团队和先进的设备，能够为客户提供高质量的RNA-seq转录组分析服务。

检测项目

• 基因表达水平定量
• 差异表达基因分析
• 可变剪切事件检测
• 基因融合检测
• 新转录本预测
• 非编码RNA分析
• SNP和突变检测
• 转录本异构体分析
• 功能富集分析
• 通路分析
• 共表达网络分析
• 样本间相关性分析
• 转录因子调控分析
• RNA编辑事件检测
• 外显子使用分析
• UTR区域分析
• 转录本结构验证
• 样本质量控制
• 数据标准化处理
• 生物标志物筛选

检测范围

• 人类转录组
• 小鼠转录组
• 大鼠转录组
• 植物转录组
• 微生物转录组
• 病毒转录组
• 癌症转录组
• 免疫细胞转录组
• 神经细胞转录组
• 干细胞转录组
• 血液转录组
• 组织特异性转录组
• 单细胞转录组
• 空间转录组
• 外泌体转录组
• 环状RNA转录组
• 长链非编码RNA转录组
• 小RNA转录组
• 全转录组
• 定向转录组

检测方法

• 总RNA提取：使用TRIzol法或柱式法提取高质量RNA
• RNA完整性检测：通过Agilent Bioanalyzer评估RNA质量
• 文库构建：采用链特异性建库方法
• polyA富集：用于mRNA测序
• rRNA去除：用于非polyA RNA测序
• 片段化：通过化学或物理方法打断RNA
• cDNA合成：使用逆转录酶合成第一链和第二链cDNA
• 末端修复：对cDNA末端进行修复和平端化
• 接头连接：连接测序接头
• PCR扩增：扩增文库
• 文库定量：通过qPCR准确量化文库
• 高通量测序：在Illumina平台上进行测序
• 原始数据质控：使用FastQC进行质量评估
• 序列比对：将reads比对到参考基因组
• 表达量计算：使用HTSeq或featureCounts计算基因表达量

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq 4000
• Illumina NextSeq 550
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Qubit Fluorometer
• Nanodrop Spectrophotometer
• Covaris S220
• Thermal Cycler
• Centrifuge
• Vortex Mixer
• Microplate Reader
• Magnetic Stand
• PCR Workstation
• Electrophoresis System
• Liquid Handling Robot

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