抗体互补决定区测序实验

信息概要

抗体互补决定区（CDR）测序实验是一种用于分析抗体可变区中互补决定区序列的高通量技术。该技术广泛应用于抗体药物开发、免疫学研究以及疾病诊断等领域。通过精准测定CDR序列，可以深入了解抗体的特异性、亲和力及多样性，为抗体工程优化和个性化医疗提供关键数据支持。

检测抗体互补决定区的重要性在于，CDR是抗体与抗原结合的核心区域，其序列变异直接影响抗体的功能特性。通过测序分析，可以评估抗体的克隆来源、亲和力成熟过程以及潜在交叉反应性，为抗体药物的安全性、有效性及质量控制提供科学依据。

检测项目

• CDR1区核苷酸序列测定
• CDR2区核苷酸序列测定
• CDR3区核苷酸序列测定
• CDR区氨基酸序列分析
• 抗体轻链可变区测序
• 抗体重链可变区测序
• 抗体框架区序列测定
• 抗体可变区全长测序
• CDR区突变频率分析
• 抗体克隆多样性评估
• CDR区长度多态性分析
• 抗体亚型鉴定
• 种系基因比对分析
• 体细胞高频突变检测
• 抗体亲和力成熟评估
• CDR区保守性分析
• 抗体翻译后修饰检测
• 抗体糖基化位点分析
• CDR区空间构象预测
• 抗体抗原结合位点模拟

检测范围

• 单克隆抗体
• 多克隆抗体
• 人源化抗体
• 嵌合抗体
• 全人源抗体
• 鼠源抗体
• 兔源抗体
• 羊源抗体
• 鸡源抗体
• 骆驼源抗体
• 鲨鱼源抗体
• 重组抗体
• 抗体片段（Fab）
• 单链抗体（scFv）
• 双特异性抗体
• 抗体药物偶联物（ADC）
• 膜表面抗体
• 分泌型抗体
• 记忆B细胞抗体
• 浆细胞抗体

检测方法

• Sanger测序：传统毛细管电泳测序技术，适用于单克隆抗体CDR区精准测序
• 高通量测序（NGS）：大规模平行测序技术，可同时分析大量抗体CDR序列
• 5'RACE PCR：快速扩增cDNA末端技术，用于全长抗体可变区扩增
• 多重PCR：同时扩增多个抗体可变区家族成员
• 单细胞测序：从单个B细胞中直接获取抗体CDR序列
• 分子克隆测序：通过载体克隆后进行序列测定
• 数字PCR：绝对定量抗体可变区拷贝数
• 质谱测序：通过质谱技术分析抗体CDR区氨基酸序列
• 杂交捕获测序：使用特异性探针富集目标CDR区域
• 纳米孔测序：实时长读长测序技术，适合复杂CDR区分析
• 免疫沉淀测序：结合抗体捕获与测序技术
• 微流控分选测序：整合细胞分选与单细胞测序
• 生物信息学分析：对原始测序数据进行拼接和注释
• 同源建模：预测CDR区三维结构
• 深度突变扫描：系统性评估CDR区突变影响

检测仪器

• ABI 3730xl DNA测序仪
• Illumina NovaSeq 6000
• Ion Torrent S5 XL
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore MinION
• Qiagen QIAcube
• Bio-Rad QX200微滴式数字PCR系统
• Thermo Fisher QuantStudio
• Agilent 2100生物分析仪
• Beckman Coulter CytoFLEX
• 10x Genomics Chromium
• BD FACSAria III
• Miltenyi Biotec MACSQuant
• Thermo Orbitrap Fusion质谱仪
• Applied Biosystems 3500遗传分析仪