大鼠肝脏肠道菌群16S rRNA实验

信息概要

大鼠肝脏肠道菌群16S rRNA实验是一种基于高通量测序技术的微生物群落分析服务，旨在通过检测16S rRNA基因序列，揭示大鼠肝脏及肠道中菌群的组成、多样性和功能特征。该检测对于研究肠道微生态与肝脏疾病的关联、药物代谢机制以及宿主-微生物互作具有重要意义，可为科研和临床提供精准的微生物组数据支持。

检测项目

• 菌群Alpha多样性分析
• 菌群Beta多样性分析
• 物种组成分析（门、纲、目、科、属、种水平）
• 核心微生物群鉴定
• 差异菌群分析
• 功能基因预测
• 群落结构聚类分析
• 样本间相似性评估
• 优势菌群占比统计
• 稀有物种检测
• 病原微生物筛查
• 益生菌丰度检测
• 菌群与代谢通路关联分析
• 样本复杂度评估
• 菌群与环境因子相关性分析
• 时间序列动态变化分析
• 菌群稳定性检测
• 样本间距离矩阵计算
• 系统发育树构建
• 微生物网络互作分析

检测范围

• 大鼠肝脏组织样本
• 大鼠肠道内容物样本
• 大鼠粪便样本
• 无菌处理样本
• 冷冻保存样本
• 福尔马林固定样本
• 石蜡包埋样本
• DNA提取物
• RNA提取物
• 混合微生物样本
• 低生物量样本
• 高降解样本
• 抗生素处理样本
• 益生菌干预样本
• 疾病模型样本
• 健康对照组样本
• 不同发育阶段样本
• 不同饮食干预样本
• 不同环境暴露样本
• 基因编辑模型样本

检测方法

• 16S rRNA基因V3-V4区扩增：通过PCR扩增目标区域
• Illumina高通量测序：采用双端测序技术
• DNA提取：使用试剂盒法提取微生物DNA
• PCR产物纯化：磁珠法去除引物和杂质
• 文库构建：添加测序接头和索引
• 质量控制：Qubit定量和Agilent质检
• 序列去噪：去除低质量和嵌合体序列
• OTU聚类：基于97%相似度划分操作分类单元
• 物种注释：比对Silva或Greengenes数据库
• 多样性指数计算：包括Shannon、Chao1等
• PCA/PCoA分析：降维可视化样本差异
• LEfSe分析：筛选生物标志物
• PICRUSt预测：功能基因组成推断
• Network分析：构建微生物互作网络
• 统计学检验：包括ANOSIM、PERMANOVA等

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Qubit 4.0荧光定量仪
• Agilent 2100生物分析仪
• PCR仪
• Nanodrop分光光度计
• 离心机
• 电泳仪
• 磁力架
• 超低温冰箱
• 超净工作台
• 恒温混匀仪
• 微量移液器
• 凝胶成像系统
• 真空浓缩仪
• 生物安全柜