人源肿瘤小鼠剪接变异检测

信息概要

人源肿瘤小鼠剪接变异检测是一种基于基因剪接变异的精准检测服务，旨在通过高通量测序技术分析小鼠模型中肿瘤相关基因的剪接变异情况。该检测对于研究肿瘤发生机制、药物靶点筛选以及个性化治疗策略的开发具有重要意义。通过检测剪接变异，可以揭示肿瘤特异性剪接事件，为肿瘤诊断和治疗提供分子层面的依据。

检测项目

• 剪接位点突变检测
• 外显子跳跃事件分析
• 内含子保留检测
• 可变剪接事件筛查
• 剪接异构体定量
• 肿瘤驱动基因剪接变异分析
• 剪接因子突变检测
• 剪接调控元件变异分析
• RNA编辑事件检测
• 融合基因剪接变异分析
• 剪接相关SNP检测
• 剪接信号序列变异分析
• 剪接调控蛋白结合位点检测
• 剪接抑制因子突变筛查
• 剪接增强因子突变筛查
• 剪接相关甲基化分析
• 剪接变异与肿瘤分型关联分析
• 剪接变异与药物敏感性分析
• 剪接变异与预后相关性研究
• 剪接变异功能预测

检测范围

• 肺癌
• 乳腺癌
• 结直肠癌
• 胃癌
• 肝癌
• 胰腺癌
• 前列腺癌
• 卵巢癌
• 脑胶质瘤
• 黑色素瘤
• 淋巴瘤
• 白血病
• 肾癌
• 膀胱癌
• 甲状腺癌
• 食管癌
• 宫颈癌
• 子宫内膜癌
• 骨肉瘤
• 神经内分泌肿瘤

检测方法

• RNA-seq：高通量转录组测序技术，用于全面检测剪接变异
• RT-PCR：验证特定剪接事件的存在和表达水平
• qPCR：定量分析剪接异构体的表达差异
• Nanopore测序：长读长测序技术，用于准确鉴定剪接异构体
• PacBio测序：全长转录本测序，用于剪接变异分析
• 微阵列分析：高通量筛查剪接相关基因表达
• Western Blot：检测剪接变异蛋白产物
• 免疫沉淀：研究剪接调控蛋白与RNA的相互作用
• 荧光原位杂交：定位剪接变异在组织中的分布
• 质谱分析：鉴定剪接变异产生的蛋白产物
• ChIP-seq：分析剪接调控因子的基因组结合位点
• CLIP-seq：研究RNA结合蛋白与剪接调控元件的相互作用
• 单细胞RNA测序：在单细胞水平分析剪接异质性
• 甲基化测序：研究表观遗传对剪接的调控
• 生物信息学预测：利用算法预测剪接变异的致病性

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Thermo Fisher QuantStudio
• Nanopore MinION
• PacBio Sequel
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• ABI 3730xl DNA Analyzer
• Thermo Fisher Q Exactive
• BD FACSAria
• Zeiss LSM 880
• Roche LightCycler 480
• Bio-Rad CFX96
• Affymetrix GeneChip Scanner
• Illumina HiSeq 4000
• Thermo Fisher Ion S5
• Agilent SureScan