裸鼠CMA实验

信息概要

裸鼠CMA（染色体微阵列分析）实验是一种高分辨率的基因组检测技术，主要用于检测裸鼠模型中的染色体拷贝数变异（CNVs）和基因组不平衡。该技术通过高通量芯片平台，能够精准识别基因组水平的微小缺失或重复，为肿瘤研究、遗传疾病模型构建及药物研发提供重要数据支持。

检测的重要性在于，裸鼠作为生物医学研究的常用模型，其基因组稳定性直接影响实验结果的可靠性。CMA技术可帮助研究人员验证模型的一致性、评估基因编辑效果，并排除潜在的基因组异常，从而确保实验数据的准确性和可重复性。

本检测服务涵盖从样本制备到数据分析的全流程，提供标准化报告，支持定制化分析需求，适用于科研机构、制药企业及第三方检测平台。

检测项目

• 基因组DNA提取纯度检测
• 染色体拷贝数变异（CNVs）分析
• 基因组不平衡区域筛查
• 微缺失/微重复检测
• 杂合性缺失（LOH）分析
• 全基因组SNP分型
• 肿瘤基因组不稳定性评估
• 基因编辑效率验证
• 染色体结构变异检测
• 端粒区域异常分析
• 基因组印记异常筛查
• 嵌合体比例计算
• 性别染色体异常检测
• 线粒体DNA拷贝数分析
• 基因组重排热点区域检测
• 致病性CNVs注释
• 多倍体现象分析
• 基因组同源重组事件检测
• 染色体重断裂点定位
• 样本间基因组一致性比对

检测范围

• 裸鼠肿瘤异种移植模型
• 基因敲除裸鼠模型
• 基因敲入裸鼠模型
• 转基因裸鼠品系
• 免疫缺陷裸鼠亚系
• 人源化免疫系统裸鼠
• 自发突变裸鼠模型
• 化学诱导突变模型
• 放射诱导基因组不稳定模型
• 遗传工程修饰（GEM）裸鼠
• PDX（人源肿瘤异种移植）模型
• 代谢疾病裸鼠模型
• 神经退行性疾病模型
• 心血管疾病模型
• 自身免疫疾病模型
• 感染性疾病模型
• 衰老研究模型
• 毒理学研究模型
• 药物代谢研究模型
• 干细胞移植评估模型

检测方法

• 微阵列杂交技术：基于芯片的基因组DNA杂交与信号捕获
• 荧光标记法：采用Cy3/Cy5荧光标记检测样本与对照差异
• 全基因组扩增：通过MDA或DOP-PCR提高低浓度样本检出率
• SNP分型分析：利用芯片探针检测单核苷酸多态性
• 数据归一化处理：采用LOESS算法消除系统误差
• 分段算法分析：应用CBS算法识别拷贝数变化边界
• QC指标计算：包括MAPD、SNQ等质控参数评估
• 数据库比对：参考Ensembl、UCSC基因组数据库注释变异
• 机器学习分类：通过SVM区分真实变异与噪音信号
• 多重PCR验证：对关键区域进行靶向验证
• 荧光原位杂交（FISH）：可疑区域的细胞学确认
• qPCR绝对定量：特定基因拷贝数的准确测定
• 数字化分析：基于Genomic Workbench进行可视化分析
• 批次效应校正：使用ComBat算法消除实验间变异
• 统计显著性检验：应用GISTIC识别高频变异区域

检测仪器

• Agilent SureScan微阵列扫描仪
• Thermo NanoDrop分光光度计
• Qubit荧光定量仪
• BioAnalyzer 2100生物分析仪
• Applied Biosystems GeneTitan系统
• Illumina HiScanSQ芯片扫描仪
• Beckman Coulter Biomek液体处理项目合作单位
• Eppendorf Mastercycler PCR仪
• Covaris M220超声破碎仪
• Roche LightCycler 480实时定量PCR仪
• Leica DM6000荧光显微镜
• Zeiss Axio Imager显微成像系统
• Thermo Scientific Heraeus离心机
• Bio-Rad ChemiDoc MP成像系统
• Sony SH800细胞分选仪