人源肿瘤小鼠染色质构象检测

信息概要

人源肿瘤小鼠染色质构象检测是一种先进的分子生物学检测服务，专注于研究人源肿瘤异种移植小鼠模型中的染色质三维结构及其动态变化。该检测通过高通量技术揭示染色质空间组织与基因调控的关系，为肿瘤发生机制、药物靶点筛选及个性化治疗提供重要依据。染色质构象检测在肿瘤研究中具有重要意义，能够帮助科研人员深入理解表观遗传调控、肿瘤异质性以及治疗耐药性等关键问题。

检测项目

• 染色质可及性检测
• 染色质环化分析
• 拓扑关联域(TAD)鉴定
• 增强子-启动子互作检测
• 核小体定位分析
• 组蛋白修饰全基因组图谱
• 染色质压缩状态评估
• 三维基因组结构重建
• 差异互作区域(DIR)分析
• 染色质动态变化追踪
• 转录因子结合位点预测
• 染色质边界特征分析
• 等位基因特异性互作检测
• 肿瘤特异性构象标志物筛选
• 多组学数据整合分析
• 染色质区室(compartment)划分
• 长距离调控元件互作验证
• 结构变异对染色质构象的影响
• 单细胞染色质构象分析
• 时间序列动态构象变化监测

检测范围

• 人源肿瘤PDX小鼠模型
• 人源肿瘤CDX小鼠模型
• 基因编辑肿瘤小鼠模型
• 免疫缺陷小鼠移植模型
• 原代肿瘤组织移植模型
• 转移性肿瘤小鼠模型
• 耐药性肿瘤小鼠模型
• 患者来源类器官模型
• 肿瘤干细胞移植模型
• 多癌种比较模型
• 治疗前后对比模型
• 不同分期肿瘤模型
• 分子分型特异性模型
• 肿瘤微环境研究模型
• 表观遗传修饰模型
• 转基因驱动肿瘤模型
• 条件性敲除肿瘤模型
• 异种移植传代模型
• 药物处理干预模型
• 放射治疗响应模型

检测方法

• Hi-C技术：全基因组染色质互作捕获与分析
• ATAC-seq：检测染色质开放区域
• ChIP-seq：分析组蛋白修饰与转录因子结合
• Capture Hi-C：靶向研究特定基因组区域互作
• DNase-seq：高分辨率染色质可及性检测
• MNase-seq：核小体定位准确分析
• 4C-seq：研究特定位点的染色质互作网络
• HiChIP：结合蛋白互作的染色质构象分析
• scHi-C：单细胞水平染色质构象解析
• Micro-C：高分辨率染色质构象图谱构建
• DamID：研究蛋白质与染色质的相互作用
• 3C-qPCR：验证特定染色质互作
• ChIA-PET：蛋白质介导的染色质互作分析
• FAIRE-seq：无偏好的染色质开放区域检测
• NOMe-seq：单分子水平染色质状态分析

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• 10x Genomics Chromium
• Bio-Rad S3e细胞分选仪
• Covaris M220超声破碎仪
• Agilent 4200 TapeStation
• Qubit 4.0荧光定量仪
• Thermo Fisher QuantStudio实时PCR仪
• Beckman Coulter Biomek i7
• Nanodrop One超微量分光光度计
• Bioruptor Pico超声仪
• Eppendorf Centrifuge 5430R
• Applied Biosystems 3500遗传分析仪