人源肿瘤小鼠CNV检测

信息概要

人源肿瘤小鼠CNV检测是一种基于高通量测序技术的基因组变异分析服务，专注于检测人源肿瘤异种移植（PDX）小鼠模型中的拷贝数变异（CNV）。该检测通过分析肿瘤基因组的结构变异，为肿瘤机制研究、药物筛选及个性化治疗提供关键数据支持。

CNV检测在肿瘤研究中具有重要意义，能够揭示肿瘤发生发展过程中的基因组不稳定性，帮助识别驱动基因、潜在治疗靶点以及耐药性相关变异。本服务采用高灵敏度和特异性的检测技术，确保数据的准确性和可靠性，为科研和临床前研究提供有力工具。

检测项目

• 全基因组拷贝数变异分析
• 染色体臂水平增益/缺失检测
• 局灶性拷贝数变异检测
• 肿瘤纯度评估
• 肿瘤异质性分析
• 驱动基因拷贝数变化
• 抑癌基因缺失检测
• 原癌基因扩增检测
• 基因组不稳定性评分
• 微卫星不稳定性分析
• 杂合性缺失（LOH）检测
• 基因组重排热点区域分析
• 肿瘤特异性CNV标志物筛选
• 药物靶点基因拷贝数评估
• 耐药性相关CNV检测
• 肿瘤进化树构建
• 亚克隆结构分析
• 转移相关CNV特征分析
• 肿瘤微环境相关CNV检测
• 免疫治疗相关CNV标志物筛查

检测范围

• 人源肿瘤PDX模型
• 人源肿瘤细胞系异种移植模型
• 原代肿瘤组织异种移植模型
• 血液系统肿瘤PDX模型
• 实体瘤PDX模型
• 转移性肿瘤PDX模型
• 耐药性肿瘤PDX模型
• 放射抗性肿瘤模型
• 化疗敏感性PDX模型
• 靶向治疗PDX模型
• 免疫治疗PDX模型
• 罕见肿瘤PDX模型
• 儿童肿瘤PDX模型
• 遗传工程小鼠肿瘤模型
• 多组学整合分析PDX模型
• 时间序列PDX样本
• 空间异质性PDX样本
• 治疗前后配对PDX样本
• 多部位转移PDX样本
• 微小残留病灶PDX模型

检测方法

• 全基因组测序（WGS）：高通量测序技术对全基因组进行深度覆盖
• 全外显子测序（WES）：针对编码区域的测序方法
• 靶向测序：针对特定基因panel的深度测序
• 比较基因组杂交（aCGH）：基于芯片的拷贝数检测技术
• 单核苷酸多态性芯片（SNP array）：全基因组SNP和CNV分析
• 数字PCR（dPCR）：高精度定量检测特定区域拷贝数
• 多重连接探针扩增（MLPA）：靶向区域拷贝数定量分析
• 荧光原位杂交（FISH）：特定染色体区域可视化检测
• 纳米孔测序：长读长实时测序技术
• 光学图谱技术：全基因组物理图谱构建
• 甲基化芯片：整合表观遗传学与拷贝数分析
• RNA-seq：转录组水平验证拷贝数变化
• 单细胞测序：单细胞分辨率CNV分析
• 循环肿瘤DNA测序：液体活检样本分析
• 长读长测序：复杂结构变异解析

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR
• Thermo Fisher QuantStudio 12K Flex
• Agilent SureScan Microarray Scanner
• Affymetrix GeneChip Scanner 3000
• Nanostring nCounter
• 10x Genomics Chromium
• Bionano Saphyr
• Fluidigm C1
• Beckman Coulter CytoFLEX
• Leica DM6 B FISH成像系统