ITS测序检测

信息概要

ITS（Internal Transcribed Spacer）测序检测是基于核糖体RNA基因间隔区的高通量测序技术，主要用于微生物（尤其是真菌）的分类鉴定、多样性分析和群落结构研究。该检测可精准解析样本中微生物的种类和丰度，广泛应用于环境监测、食品安全、医药研发及农业病害防控等领域。通过ITS测序检测，用户能够快速识别潜在病原菌、评估微生物生态功能，并为质量控制提供科学依据，是保障生物安全和生态健康的关键技术手段。

检测项目

• ITS序列比对分析
• 真菌物种分类鉴定
• 微生物多样性指数计算
• 优势菌群丰度评估
• 样本间群落结构差异分析
• 潜在致病真菌筛查
• 共生微生物互作关系预测
• 环境适应性基因检测
• 污染物降解菌株筛选
• 样本纯度与污染评估
• 功能基因注释分析
• 系统发育树构建
• 稀有物种检测灵敏度测试
• ITS序列变异位点分析
• 样本存储稳定性验证
• 引物特异性验证
• 跨物种交叉污染检测
• 序列拼接完整性评估
• 微生物代谢通路预测
• ITS序列全长覆盖度评估

检测范围

• 环境样本（土壤、水体、空气）
• 食品及发酵制品
• 药用植物及中药材
• 临床组织与体液样本
• 农业病害植株
• 工业发酵微生物样本
• 动物肠道微生物组
• 化妆品微生物污染样本
• 海洋与极端环境微生物
• 实验室培养菌株
• 污水处理系统生物膜
• 益生菌制剂
• 转基因作物微生物组
• 文化遗产保护微生物样本
• 昆虫共生微生物
• 乳制品发酵菌群
• 生物降解材料微生物群落
• 病原真菌宿主溯源样本
• 植物根际微生物组
• 空气净化系统微生物监测

检测方法

• PCR扩增：使用特异性引物扩增ITS区域
• Sanger测序：单克隆片段双向测序验证
• 高通量测序：基于Illumina平台的宏基因组测序
• 荧光定量PCR：靶向物种绝对定量分析
• 克隆文库构建：低复杂度样本深度分析
• 生物信息学分析：OTU聚类与注释
• 三代测序：PacBio平台全长ITS序列解析
• 变性梯度凝胶电泳（DGGE）：快速群落差异检测
• 荧光标记探针杂交：特定病原菌筛查
• 纳米孔测序：实时长读长序列捕获
• 多重PCR：多靶标并行扩增
• qPCR熔解曲线分析：引物特异性验证
• 宏转录组测序：活性微生物功能研究
• 单细胞测序：稀有微生物单细胞分选
• 芯片杂交技术：快速物种鉴定

检测仪器

• Illumina MiSeq测序仪
• ABI 3730xl DNA测序仪
• QuantStudio实时定量PCR仪
• PacBio Sequel三代测序平台
• Nanopore MinION测序仪
• Bio-Rad PCR仪
• Agilent 2100生物分析仪
• Qubit荧光定量仪
• Thermo NanoDrop分光光度计
• Beckman Coulter离心机
• Eppendorf微量移液器
• BioTek酶标仪
• Labconco超净工作台
• Omni国际标准生物安全柜
• Illumina NovaSeq 6000高通量测序仪

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