转录组测序检测

信息概要

转录组测序检测是通过高通量测序技术全面分析生物样本中RNA组成及表达水平的技术手段。该检测能够揭示基因表达差异、可变剪切事件、非编码RNA功能及调控网络，为疾病机制研究、药物开发及生物标记物发现提供关键数据。其重要性在于通过精准解析转录组信息，推动基础科研与临床应用的深度融合，助力个性化医疗和精准医学发展。

检测项目

• RNA提取质量评估
• mRNA文库构建
• small RNA测序分析
• 长链非编码RNA检测
• 差异表达基因筛选
• 基因可变剪切分析
• 融合基因检测
• SNP/InDel变异检测
• 功能富集分析（GO/KEGG）
• 共表达网络构建
• 转录因子调控预测
• 样本间相关性分析
• 基因表达聚类分析
• RNA编辑位点鉴定
• circRNA鉴定与定量
• 外显子表达定量
• 转录本异构体分析
• 基因表达趋势分析
• 样本间差异可变剪切事件检测
• RNA病毒序列筛查

检测范围

• 人类全血样本
• 动物组织样本
• 植物叶片样本
• 细胞系培养物
• 微生物菌体
• 肿瘤活检组织
• 血清/血浆游离RNA
• 脑脊液样本
• 单细胞悬液
• 石蜡包埋组织
• 唾液样本
• 尿液沉淀物
• 昆虫样本
• 海洋生物样本
• 古生物化石样本
• 模式生物胚胎组织
• 类器官培养物
• 外泌体RNA
• 病毒感染的宿主细胞
• 转基因生物样本

检测方法

• PolyA富集法（分离mRNA）
• rRNA去除法（保留非编码RNA）
• SMARTer链特异性建库（保留链方向信息）
• 单细胞转录组建库（10x Genomics平台）
• 全长转录本测序（PacBio Iso-Seq）
• 数字基因表达谱（DGE）分析
• miRNA测序（small RNA-Seq）
• 空间转录组技术（Visium）
• 靶向捕获测序（Panel定制）
• 甲基化RNA免疫沉淀测序（MeRIP-Seq）
• RNA结合蛋白免疫沉淀测序（RIP-Seq）
• 翻译组测序（Ribo-Seq）
• 染色质结合RNA测序（ChIRP-Seq）
• RNA原位杂交（FISH）验证
• 实时荧光定量PCR（qRT-PCR）验证

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
• PacBio Sequel IIe
• Oxford Nanopore PromethION
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Qubit 4.0 Fluorometer
• Covaris M220超声破碎仪
• Beckman Coulter Biomek NXP
• 10x Genomics Chromium Controller
• NanoDrop One分光光度计
• Thermal Cycler PCR仪
• BD FACSAria III流式细胞仪
• Leica CM1950冰冻切片机
• Nanostring GeoMx DSP
• Affymetrix GeneChip Scanner

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