RNA测序质量检测

信息概要

RNA测序质量检测是基因表达分析中的重要环节，通过对RNA样本的质量、纯度、完整性等进行全面评估，确保后续测序数据的准确性和可靠性。高质量的RNA样本是获得可信测序结果的前提，因此RNA测序质量检测在基因组学、转录组学以及临床诊断等领域具有不可替代的作用。

本检测服务涵盖RNA样本的多个关键参数，包括浓度、纯度、降解程度、污染检测等，通过标准化流程和先进技术为客户提供精准的检测报告。我们的服务适用于科研机构、医疗机构以及生物技术企业，助力客户在RNA相关研究中获得高质量数据。

检测项目

• RNA浓度：测定RNA样本的浓度，确保其符合测序要求。
• RNA纯度（A260/A280）：评估RNA样本中蛋白质污染的程度。
• RNA纯度（A260/A230）：检测RNA样本中盐类或有机溶剂的残留。
• RNA完整性（RIN值）：通过电泳分析RNA的降解程度。
• 28S/18S比值：评估RNA完整性的重要指标。
• DV200值：测定RNA片段大于200nt的比例。
• RNA降解程度：检测RNA是否发生明显降解。
• DNA污染：检测RNA样本中是否存在基因组DNA污染。
• 蛋白质污染：评估RNA样本中蛋白质残留量。
• 盐离子污染：检测RNA样本中盐离子的浓度。
• 有机溶剂残留：评估RNA提取过程中有机溶剂的残留情况。
• pH值：测定RNA溶液的酸碱度。
• RNA片段分布：分析RNA片段的大小分布情况。
• rRNA比例：检测核糖体RNA在总RNA中的占比。
• mRNA比例：评估信使RNA在总RNA中的比例。
• miRNA比例：检测微小RNA在总RNA中的含量。
• lncRNA比例：评估长链非编码RNA的存在情况。
• circRNA比例：检测环状RNA的含量。
• 外源RNA污染：评估样本中是否存在外源RNA污染。
• 内毒素检测：检测RNA样本中内毒素的含量。
• RNase活性：评估RNA样本中RNase的活性。
• RNA氧化程度：检测RNA是否发生氧化损伤。
• RNA甲基化水平：评估RNA甲基化修饰的程度。
• RNA二级结构：分析RNA的二级结构稳定性。
• RNA适配性：评估RNA是否适合特定测序平台。
• RNA保存状态：检测RNA样本的长期保存状态。
• RNA冻融稳定性：评估RNA样本在冻融循环中的稳定性。
• RNA运输稳定性：检测RNA在运输过程中的稳定性。
• RNA批次一致性：评估不同批次RNA样本的一致性。
• RNA功能性验证：通过功能性实验验证RNA的质量。

检测范围

• 总RNA
• mRNA
• miRNA
• lncRNA
• circRNA
• tRNA
• rRNA
• snRNA
• snoRNA
• scaRNA
• piRNA
• siRNA
• shRNA
• dsRNA
• ssRNA
• 病毒RNA
• 细菌RNA
• 真菌RNA
• 植物RNA
• 动物RNA
• 人类RNA
• 细胞RNA
• 组织RNA
• 血液RNA
• 尿液RNA
• 唾液RNA
• 脑脊液RNA
• FFPE样本RNA
• 单细胞RNA
• 外泌体RNA

检测方法

• 紫外分光光度法：测定RNA浓度和纯度。
• 琼脂糖凝胶电泳：评估RNA完整性。
• 毛细管电泳：准确分析RNA片段分布。
• Bioanalyzer检测：通过微流控芯片评估RNA质量。
• Qubit荧光定量：高灵敏度测定RNA浓度。
• RT-qPCR：检测特定RNA分子的存在和含量。
• 数字PCR：绝对定量RNA分子。
• RNA-Seq：高通量测序评估RNA质量。
• Northern blot：检测特定RNA的大小和丰度。
• RNA甲基化测序：分析RNA甲基化修饰。
• RNA氧化检测：通过化学方法检测RNA氧化程度。
• RNase活性检测：评估样本中RNase的活性。
• 内毒素检测：通过鲎试剂法检测内毒素。
• DNA酶处理：去除DNA污染。
• 蛋白质酶处理：去除蛋白质污染。
• 盐离子去除：通过柱纯化去除盐离子。
• 有机溶剂去除：通过蒸发或柱纯化去除有机溶剂。
• pH测定：使用pH计测定RNA溶液的酸碱度。
• RNA片段筛选：通过磁珠或柱纯化筛选特定大小的RNA片段。
• RNA保存评估：通过长期保存实验评估RNA稳定性。
• RNA冻融实验：评估RNA在冻融循环中的稳定性。
• RNA运输模拟：模拟运输条件评估RNA稳定性。
• RNA功能性实验：通过体外翻译或转染验证RNA功能。
• RNA二级结构预测：通过软件预测RNA二级结构。
• RNA适配性测试：通过测序平台测试RNA的适配性。

检测仪器

• Nanodrop分光光度计
• Qubit荧光定量仪
• Bioanalyzer 2100
• TapeStation
• Agilent 4200 TapeStation
• Fragment Analyzer
• QuantStudio实时荧光定量PCR仪
• LightCycler 480
• 数字PCR仪
• Illumina测序仪
• PacBio测序仪
• Oxford Nanopore测序仪
• pH计
• 离心机
• 电泳仪