变异链球菌耐药克隆多样性测试

信息概要

变异链球菌耐药克隆多样性测试是一项针对口腔致病菌变异链球菌的耐药性及克隆多样性分析的专项检测服务。该检测通过先进的分子生物学技术，全面评估变异链球菌的耐药基因分布、克隆传播特征及其遗传多样性，为临床治疗、流行病学研究和公共卫生防控提供科学依据。

耐药性问题是公共卫生领域的重大挑战，而变异链球菌作为龋病和感染性心内膜炎的主要病原菌，其耐药克隆的传播可能加剧治疗难度。通过本检测，可精准识别耐药菌株、追踪传播路径，并指导个性化用药方案的制定，对遏制耐药性扩散具有重要意义。

检测项目

• 耐药基因ermB检测
• 耐药基因tetM检测
• 耐药基因catQ检测
• 耐药基因mefA检测
• 耐药基因bcrAB检测
• 青霉素结合蛋白基因突变分析
• 大环内酯类耐药表型测试
• 四环素类耐药表型测试
• 氯霉素类耐药表型测试
• 氟喹诺酮类耐药表型测试
• MLSB耐药表型检测
• 生物膜形成能力评估
• 毒力因子gtfB基因检测
• 毒力因子gbpB基因检测
• 毒力因子comDE基因检测
• 多位点序列分型(MLST)
• 脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型
• 全基因组SNP分析
• 质粒携带耐药基因筛查
• 转座子整合位点分析

检测范围

• 临床分离变异链球菌
• 口腔生物膜样本
• 龋病病变组织
• 牙菌斑样本
• 心内膜炎患者血液培养物
• 唾液样本
• 龈沟液样本
• 牙髓感染样本
• 种植体周围炎样本
• 儿童早期龋病样本
• 抗生素治疗前后对比样本
• 医院环境拭子
• 牙科器械生物膜
• 母婴传播配对样本
• 社区流行病学筛查样本
• 野生动物口腔样本
• 古代牙齿化石样本
• 基因工程改造菌株
• 抗生素压力选择实验菌株
• 国际标准菌株库样本

检测方法

• 实时荧光定量PCR：高灵敏度检测耐药基因表达量
• 全基因组测序：解析菌株完整遗传背景
• 微滴式数字PCR：绝对定量低频突变
• 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)：快速菌种鉴定
• 高通量药敏试验：自动化测定最小抑菌浓度
• 脉冲场凝胶电泳：大片段DNA分离与克隆溯源
• 多位点序列分型：基于管家基因的系统发育分析
• 荧光原位杂交：空间定位耐药基因
• 逆转录PCR：检测耐药基因转录活性
• 宏基因组测序：复杂样本中耐药组分析
• 单分子实时测序：检测表观遗传修饰
• 流式细胞术：评估异质性耐药亚群
• 基因芯片：并行筛查数百种耐药标记
• 克隆形成实验：定量菌株适应性代价
• 转座子突变库筛选：鉴定耐药相关基因

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000测序仪
• Nanopore GridION测序仪
• ABI QuantStudio 7 Flex实时PCR仪
• Bio-Rad QX200微滴式数字PCR系统
• Bruker MALDI Biotyper质谱仪
• VITEK 2 Compact全自动药敏系统
• CHEF Mapper脉冲场电泳系统
• BD FACSAria III流式细胞仪
• Affymetrix GeneChip扫描仪
• Agilent 4200 TapeStation生物分析仪
• Thermo Fisher Orbitrap Fusion质谱仪
• Qiagen QIAcube核酸提取项目合作单位
• Beckman Coulter Biomek i7自动化项目合作单位
• Olympus BX63荧光显微镜
• PerkinElmer EnVision多功能酶标仪