裸鼠基因组测序实验

信息概要

裸鼠基因组测序实验是一项基于高通量测序技术的基因组分析服务，旨在通过对裸鼠基因组的全面测序，揭示其遗传特征、变异信息及功能基因分布。该检测服务在生物医学研究、药物开发及疾病模型构建等领域具有重要应用价值，能够为科研人员提供精准的基因组数据支持。

基因组测序的重要性在于，它可以帮助研究者深入理解裸鼠的遗传背景，为实验结果的可靠性和可重复性提供保障。此外，通过检测基因组变异，可以筛选与特定表型相关的基因，为后续功能研究奠定基础。

检测项目

• 全基因组测序
• 外显子组测序
• 转录组测序
• 单核苷酸多态性分析
• 插入缺失变异检测
• 结构变异分析
• 拷贝数变异检测
• 基因表达谱分析
• 甲基化测序
• 染色质开放性测序
• 宏基因组测序
• 长读长测序
• 小RNA测序
• 环状RNA测序
• lncRNA测序
• miRNA测序
• 基因融合检测
• 等位基因特异性表达分析
• 功能注释分析
• 进化分析

检测范围

• 裸鼠全基因组
• 裸鼠外显子组
• 裸鼠转录组
• 裸鼠线粒体基因组
• 裸鼠Y染色体
• 裸鼠X染色体
• 裸鼠常染色体
• 裸鼠启动子区域
• 裸鼠增强子区域
• 裸鼠沉默子区域
• 裸鼠编码区
• 裸鼠非编码区
• 裸鼠重复序列
• 裸鼠转座子
• 裸鼠假基因
• 裸鼠调控元件
• 裸鼠可变剪切区域
• 裸鼠UTR区域
• 裸鼠CpG岛
• 裸鼠着丝粒区域

检测方法

• Illumina测序技术：基于边合成边测序原理的高通量测序方法
• PacBio SMRT测序：利用单分子实时测序技术获取长读长序列
• Oxford Nanopore测序：通过纳米孔电信号变化实现实时测序
• 全基因组重测序：对基因组进行高深度测序以检测变异
• RNA-Seq：通过测序分析基因表达水平
• ChIP-Seq：结合染色质免疫沉淀与测序技术分析蛋白-DNA相互作用
• ATAC-Seq：检测染色质开放性
• Hi-C：研究三维基因组结构
• Bisulfite测序：分析DNA甲基化状态
• 单细胞测序：在单细胞水平解析基因组信息
• 宏基因组测序：研究复杂微生物群落
• 靶向捕获测序：针对特定区域进行富集测序
• de novo组装：对未知基因组进行从头组装
• 比较基因组学分析：通过比对揭示物种间差异
• 群体遗传学分析：研究群体内遗传变异分布

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• Illumina MiSeq
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• Oxford Nanopore MinION
• BGI MGISEQ-2000
• Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
• Thermo Fisher Ion Torrent PGM
• 10x Genomics Chromium
• Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Nanodrop分光光度计
• Qubit荧光定量仪
• PCR仪