植物多组学数据整合检测

信息概要

植物多组学数据整合检测是通过整合基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等多层次数据，系统性解析植物生物学过程的技术服务。该检测能够全面揭示植物遗传调控网络、代谢通路及环境适应性机制，为品种改良、抗逆性研究、功能基因挖掘等提供科学依据。检测的重要性在于通过多维数据互补与验证，提升研究结果的准确性和可靠性，助力农业可持续发展与生物技术创新。

检测项目

• 全基因组重测序
• 转录组测序（RNA-Seq）
• 小RNA测序
• 甲基化测序（BS-Seq）
• 蛋白质组质谱分析
• 代谢组靶向/非靶向分析
• 单细胞转录组测序
• 表观遗传修饰分析
• 基因表达差异分析
• SNP/InDel变异检测
• 基因共表达网络构建
• 代谢通路富集分析
• 蛋白互作网络预测
• 染色体结构变异检测
• 多组学数据联合分析
• 基因家族进化分析
• 启动子区功能注释
• 非编码RNA功能预测
• 表型-基因型关联分析
• 环境胁迫响应基因筛选

检测范围

• 粮食作物（水稻、小麦、玉米）
• 经济作物（棉花、大豆、油菜）
• 园艺植物（番茄、黄瓜、花卉）
• 林木类（松树、杨树、桉树）
• 药用植物（人参、灵芝、黄芪）
• 藻类与苔藓
• 濒危保护植物
• 转基因植物材料
• 野生近缘种质资源
• 突变体库筛选样本
• 杂交育种后代群体
• 逆境处理实验样本
• 病原互作研究材料
• 组织特异性样本（根、茎、叶）
• 不同发育阶段样本
• 光合作用相关物种
• 次生代谢产物富集物种
• 能源植物（芒草、柳枝稷）
• 模式植物（拟南芥、烟草）
• 古植物化石DNA样本

检测方法

• 二代测序（NGS）：高通量DNA/RNA序列测定
• 三代测序（PacBio/Nanopore）：长片段基因组组装
• 液相色谱-质谱联用（LC-MS）：小分子代谢物鉴定
• 气相色谱-质谱联用（GC-MS）：挥发性化合物分析
• 免疫共沉淀测序（ChIP-Seq）：蛋白-DNA互作研究
• 双荧光素酶报告系统：启动子活性验证
• CRISPR/Cas9编辑验证：基因功能确证
• 荧光定量PCR（qPCR）：基因表达定量
• Western Blot：蛋白表达水平检测
• 酵母双杂交：蛋白互作验证
• 代谢流分析（Metabolic Flux）：通路动态解析
• 染色体构象捕获（Hi-C）：三维基因组研究
• 原位杂交（FISH）：基因定位分析
• 同位素标记相对定量（iTRAQ）：蛋白质组定量
• 表型组成像系统：形态特征数字化采集

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000测序仪
• PacBio Sequel IIe测序系统
• Thermo Q Exactive质谱仪
• Agilent 7890B气相色谱仪
• AB Sciex TripleTOF 6600
• Bio-Rad CFX Connect荧光定量PCR仪
• Nanopore GridION测序设备
• Leica TCS SP8共聚焦显微镜
• Beckman Coulter流式细胞仪
• Qiagen BioSprint核酸提取项目合作单位
• PerkinElmer EnVision多功能酶标仪
• Zeiss Axio Observer显微成像系统
• Waters ACQUITY UPLC超液相色谱
• Illumina HiSeq X Ten测序平台
• Miltenyi Biotec MACSQuant细胞分选仪

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