植物染色质高级结构检测

信息概要

植物染色质高级结构检测是通过分析染色质的三维构象、空间排布及其动态变化，揭示基因表达调控机制的重要技术手段。该检测服务面向科研机构、农业育种企业及生物技术公司，提供染色质相互作用、拓扑关联域（TADs）分析、核小体定位等高精度数据，助力植物表观遗传学研究、作物遗传改良及抗逆性开发。检测结果可为功能基因组学、分子育种及合成生物学领域提供关键数据支撑。

检测项目

• 染色质三维构象分析
• 染色质互作频率检测
• 拓扑关联域（TADs）边界定位
• 核小体占位与间距测定
• 染色质可及性评估
• Hi-C技术全基因组互作图谱构建
• 染色质环（Chromatin Loops）识别
• 组蛋白修饰空间分布分析
• 染色体区室（A/B Compartment）划分
• 染色质动态压缩状态监测
• 转座酶可及染色质测序（ATAC-seq）整合分析
• DNA甲基化与染色质结构关联研究
• 增强子-启动子互作验证
• 异染色质与常染色质边界鉴定
• 染色质重塑因子作用位点检测
• 单细胞染色质构象分析
• 荧光原位杂交（FISH）空间验证
• 染色质断裂与修复位点定位
• 基因组三维模型重构
• 环境胁迫下染色质结构动态变化追踪

检测范围

• 粮食作物（水稻、小麦、玉米）
• 经济作物（棉花、大豆、油菜）
• 园艺植物（番茄、拟南芥、菊花）
• 林木类（杨树、松树、桉树）
• 药用植物（人参、甘草、青蒿）
• 藻类与苔藓植物
• 转基因植物品系
• 突变体与遗传修饰材料
• 野生型与栽培种对比样本
• 多倍体植物（如马铃薯）
• 濒危保护植物
• 极端环境适应型植物
• 作物杂交后代群体
• 植物病原互作样本
• 植物组织特异性样本（根/叶/花）
• 不同发育阶段样本
• 表观遗传修饰植株
• 人工合成染色体材料
• 植物细胞系与原生质体
• 植物病毒侵染样本

检测方法

• Hi-C技术（全基因组染色质互作捕获）
• ChIP-seq（染色质免疫共沉淀测序）
• ATAC-seq（转座酶可及染色质测序）
• DNase-seq（核酸酶超敏感位点测序）
• MNase-seq（微球菌核酸酶消化测序）
• 3C/4C/5C技术（染色体构象捕获系列）
• Single-cell Hi-C（单细胞染色质构象分析）
• ChromEMT（染色质电子显微镜断层扫描）
• FISH（荧光原位杂交空间验证）
• ChIA-PET（染色质互作分析配对末端标签测序）
• DamID（DNA腺嘌呤甲基转移酶识别技术）
• CUT&Tag（靶向染色质蛋白定位分析）
• Micro-C（高分辨率染色质构象分析）
• SPRITE（多重染色质互作捕获技术）
• GAM（基因组结构显微切割技术）

检测仪器

• 高通量测序仪（Illumina NovaSeq）
• 第三代测序仪（PacBio Sequel II）
• 冷冻透射电子显微镜
• 染色体显微切割系统
• 激光共聚焦显微镜
• 超高速离心机
• 荧光定量PCR仪
• 超声破碎仪
• 生物分析仪（Agilent 4200）
• 流式细胞分选仪
• 自动化液体处理项目合作单位
• 质谱仪（Q-Exactive HF-X）
• 微量紫外分光光度计
• 低温恒温培养箱
• 三维基因组数据计算服务器

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