植物单细胞多组学检测

信息概要

植物单细胞多组学检测是通过高通量技术对植物个体中单个细胞的基因组、转录组、表观组和蛋白质组等多维度数据进行综合分析的服务。该检测能够揭示细胞异质性、功能分化机制及基因调控网络，为植物发育研究、抗逆机制解析和遗传改良提供精准数据支持。其重要性在于突破传统批量检测的局限性，实现细胞层面的精细解析，助力精准农业和合成生物学发展。

检测项目

• 单细胞基因组测序
• 单细胞转录组测序
• 单细胞表观组分析（ATAC-seq）
• 单细胞蛋白质组定量
• 单细胞代谢组分析
• 细胞表面标记物检测
• 细胞周期状态分析
• 细胞分化轨迹推断
• 基因共表达网络构建
• 细胞亚群聚类分析
• 差异表达基因筛选
• 可变剪接事件检测
• 染色质开放性区域定位
• DNA甲基化水平测定
• 染色质互作分析（Hi-C）
• 细胞间通讯网络解析
• 基因功能富集分析
• 突变位点检测与注释
• 非编码RNA表达谱分析
• 细胞应激响应通路活性评估

检测范围

• 农作物（水稻、小麦、玉米）
• 经济作物（棉花、大豆、油菜）
• 园艺植物（花卉、果蔬）
• 林木（松树、杉木、桉树）
• 药用植物（人参、黄芪、枸杞）
• 苔藓类植物
• 蕨类植物
• 藻类（微藻、大型海藻）
• 模式植物（拟南芥、烟草）
• 濒危珍稀植物
• C3与C4光合作用植物
• 极端环境适应植物（耐旱、耐盐）
• 转基因植株
• 突变体库材料
• 杂交育种后代
• 病原体感染植物样本
• 共生微生物互作植物
• 组织培养再生植株
• 不同发育阶段植株
• 器官特异性细胞（根尖、叶肉、维管束）

检测方法

• 单细胞RNA测序（scRNA-seq）：基于微流控技术捕获单个细胞并分析转录本
• 单核测序（snRNA-seq）：适用于难以分离完整细胞的植物组织
• 转座酶可及染色质测序（ATAC-seq）：解析染色质开放区域
• 质谱流式细胞术（CyTOF）：高维度蛋白质组分析
• 单细胞甲基化测序（scBS-seq）：检测全基因组DNA甲基化
• 空间转录组学（Visium）：保留细胞空间位置信息
• 单细胞Hi-C：三维基因组结构解析
• 荧光激活细胞分选（FACS）：特定细胞群分离
• 激光捕获显微切割（LCM）：目标细胞精准采集
• 代谢组质谱分析（LC-MS/MS）：小分子代谢物定量
• 单细胞基因组扩增（MALBAC）：全基因组扩增技术
• CRISPR-based lineage tracing：细胞谱系追踪
• 原位杂交（FISH）：基因空间表达定位
• 单细胞ChIP-seq：表观遗传修饰分析
• 微流体液滴技术（Drop-seq）：高通量单细胞捕获

检测仪器

• 10x Genomics Chromium系统
• Illumina NovaSeq 6000测序仪
• BD FACSAria流式细胞仪
• Thermo Fisher Orbitrap Fusion质谱仪
• Nanostring GeoMx数字空间分析系统
• Fluidigm C1单细胞自动制备系统
• Agilent 2100生物分析仪
• PacBio Sequel II测序平台
• Zeiss LSM 880共聚焦显微镜
• Beckman Coulter MoFlo Astrios细胞分选仪
• Qiagen QIAcuity数字PCR系统
• Miltenyi Biotec MACSQuant流式分析仪
• Oxford Nanopore PromethION测序设备
• Bruker timsTOF Pro质谱仪
• Leica LMD7000激光显微切割系统

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