人源肿瘤小鼠CGH检测

信息概要

人源肿瘤小鼠CGH检测是一种基于比较基因组杂交技术的检测服务，专门用于分析人源肿瘤小鼠模型中的基因组变异。该检测能够全面评估肿瘤基因组中的拷贝数变异（CNVs）、扩增、缺失等遗传异常，为肿瘤机制研究和药物开发提供关键数据。

该检测的重要性在于：通过高通量技术精准识别肿瘤相关基因的异常，帮助研究人员理解肿瘤发生发展的分子机制，并为个性化治疗策略的制定提供科学依据。此外，该检测还可用于评估药物对肿瘤基因组的影响，加速抗癌药物的研发进程。

检测项目

• 基因组DNA提取质量评估
• 全基因组拷贝数变异（CNV）分析
• 染色体非整倍性检测
• 肿瘤驱动基因扩增检测
• 抑癌基因缺失检测
• 微卫星不稳定性（MSI）分析
• 低拷贝数重复区域检测
• 端粒区域变异分析
• 基因融合事件筛查
• 杂合性缺失（LOH）检测
• 肿瘤异质性评估
• 克隆性变异分析
• 基因组不稳定性指数计算
• 特定染色体区域焦点分析
• 肿瘤进化相关变异追踪
• 治疗耐药相关变异检测
• 肿瘤微环境相关基因变异分析
• 表观遗传修饰相关区域检测
• 免疫治疗靶点基因变异筛查
• 肿瘤转移相关基因变异分析

检测范围

• 人源肿瘤异种移植（PDX）模型
• 条件性基因敲除肿瘤模型
• 转基因肿瘤小鼠模型
• 化学诱导肿瘤模型
• 放射诱导肿瘤模型
• 病毒诱导肿瘤模型
• 自发肿瘤模型
• 移植瘤模型
• 基因编辑肿瘤模型
• 免疫缺陷小鼠肿瘤模型
• 人源化免疫系统肿瘤模型
• 肿瘤干细胞移植模型
• 转移性肿瘤模型
• 原位移植肿瘤模型
• 多器官肿瘤模型
• 耐药性肿瘤模型
• 复发肿瘤模型
• 微小残留病灶模型
• 肿瘤微环境研究模型
• 治疗响应预测模型

检测方法

• 比较基因组杂交（CGH）技术：通过荧光标记和杂交比较肿瘤与正常基因组差异
• 微阵列CGH（aCGH）：使用高密度寡核苷酸芯片进行全基因组扫描
• 新一代测序（NGS）验证：对关键变异进行深度测序确认
• 实时荧光定量PCR（qPCR）：特定区域拷贝数定量分析
• 多重连接探针扩增（MLPA）：靶向基因拷贝数检测
• 荧光原位杂交（FISH）：染色体水平变异验证
• 数字PCR（dPCR）：绝对拷贝数定量
• 基因组DNA片段化分析：评估样本质量
• 生物信息学分析：变异注释和功能预测
• 统计学分析：显著性变异筛选
• 主成分分析（PCA）：样本聚类和质量控制
• 基因组可视化分析：变异区域图谱绘制
• 变异数据库比对：已知肿瘤变异注释
• 功能富集分析：变异基因通路分析
• 肿瘤纯度评估：计算样本中肿瘤细胞比例

检测仪器

• Agilent微阵列扫描仪
• Illumina测序仪
• ABI实时荧光定量PCR仪
• Nanodrop分光光度计
• Qubit荧光计
• Bioanalyzer生物分析仪
• Covaris超声破碎仪
• Thermal cycler PCR仪
• 荧光显微镜
• 离心机
• 微量移液器
• 电泳系统
• 杂交炉
• 恒温培养箱
• 生物安全柜