裸鼠微生物组实验

信息概要

裸鼠微生物组实验是一种针对无毛鼠（裸鼠）体内外微生物群落组成和功能的研究项目。该实验通过高通量测序、培养组学等技术，全面分析裸鼠肠道、皮肤等部位的微生物多样性、丰度及代谢功能，为疾病模型研究、药物评估和免疫机制探索提供关键数据。

检测裸鼠微生物组的重要性在于：揭示微生物与宿主的互作机制，评估抗生素或益生菌干预效果，辅助肿瘤学、免疫学等研究，确保实验动物的微生物背景一致性，从而提升科研数据的可靠性和可重复性。

本检测服务涵盖样本采集、DNA提取、测序分析及生物信息学解读，支持个性化方案设计，适用于科研机构、药企及CRO公司。

检测项目

• 16S rRNA基因测序（V3-V4区）
• 宏基因组测序
• α多样性指数（Shannon/Chao1）
• β多样性分析（PCoA/NMDS）
• 物种组成（门/纲/属水平）
• 核心微生物群鉴定
• 病原微生物筛查
• 抗生素耐药基因检测
• 短链脂肪酸含量
• 微生物功能预测（KEGG/COG）
• 菌群代谢通路分析
• 真菌ITS测序
• 病毒组检测
• 微生物负荷定量（qPCR）
• 条件致病菌丰度
• 乳酸菌/Bifidobacterium比例
• 微生物与宿主共进化分析
• 菌群稳定性评估
• 样本间差异物种（LEfSe）
• 微生物标志物筛选

检测范围

• 无菌裸鼠
• SPF级裸鼠
• 常规饲养裸鼠
• 抗生素处理裸鼠
• 益生菌干预裸鼠
• 高脂饮食模型裸鼠
• 肿瘤模型裸鼠
• 免疫缺陷裸鼠
• 肠道微生物移植裸鼠
• 皮肤微生物组裸鼠
• 呼吸道微生物组裸鼠
• 生殖道微生物组裸鼠
• 老年裸鼠模型
• 幼年裸鼠模型
• 糖尿病模型裸鼠
• 炎症性肠病模型裸鼠
• 神经疾病模型裸鼠
• 辐射暴露裸鼠
• 药物代谢研究裸鼠
• 基因编辑裸鼠

检测方法

• Illumina NovaSeq测序（双端300bp高通量测序）
• PacBio SMRT测序（长读长全长16S分析）
• QIIME2分析流程（微生物群落多样性计算）
• MetaPhlAn4（物种组成精准注释）
• HUMAnN3（宏基因组功能预测）
• GC-MS（短链脂肪酸定量检测）
• 实时荧光定量PCR（特定菌属绝对定量）
• 厌氧培养法（可培养微生物分离）
• MALDI-TOF MS（微生物快速鉴定）
• Shotgun宏基因组学（全基因组随机测序）
• ITS扩增子测序（真菌群落分析）
• Virome序列捕获（病毒颗粒富集技术）
• PICRUSt2（基于16S的功能预测）
• LEfSe分析（生物标志物挖掘）
• SPADE算法（微生物互作网络构建）

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• PacBio Sequel II
• Qubit 4.0荧光计
• Nanodrop One超微量分光光度计
• Agilent 4200 TapeStation
• Thermo Fisher QuantStudio 7
• Eppendorf 5430离心机
• Coy Anaerobic Chamber
• Bruker MALDI Biotyper
• Agilent 7890B GC-MS
• Beckman Coulter Biomek i7
• Illumina MiSeq Dx
• Oxford Nanopore GridION
• Bio-Rad CFX Opus
• Miltenyi GentleMACS