转录组测序分析

信息概要

转录组测序分析是一种高通量测序技术，通过对细胞或组织中的全部RNA进行测序，揭示基因表达水平、可变剪接、新转录本发现等关键信息。该技术广泛应用于生命科学研究、疾病机制探索、药物开发及临床诊断等领域。

转录组测序分析的重要性在于其能够全面、精准地解析基因表达谱，帮助研究者理解生物过程的调控机制，识别疾病相关生物标志物，并为个性化医疗提供科学依据。该检测服务可为科研机构、医疗机构及企业提供高质量的测序数据和深度分析报告。

本检测服务涵盖从样本制备、文库构建、高通量测序到生物信息学分析的全流程，确保数据的可靠性和可重复性。我们的第三方检测机构拥有先进的测序平台和的分析团队，可满足不同研究需求的定制化服务。

检测项目

• 总RNA提取与质量检测
• mRNA富集与纯化
• rRNA去除效率评估
• 文库构建与质检
• 高通量测序（Illumina平台）
• 原始数据质量控制
• 序列比对与参考基因组映射
• 基因表达定量分析
• 差异表达基因分析
• 可变剪接事件检测
• 新转录本预测与注释
• 基因融合检测
• SNP与InDel变异分析
• 功能富集分析（GO、KEGG）
• 蛋白互作网络分析
• lncRNA鉴定与功能预测
• circRNA鉴定与表达分析
• miRNA靶基因预测
• 样本间相关性分析
• 主成分分析（PCA）

检测范围

• 人类转录组测序
• 小鼠转录组测序
• 大鼠转录组测序
• 植物转录组测序
• 微生物转录组测序
• 癌症组织转录组测序
• 血液样本转录组测序
• 脑组织转录组测序
• 肝脏组织转录组测序
• 心脏组织转录组测序
• 肺组织转录组测序
• 肠道组织转录组测序
• 胚胎组织转录组测序
• 干细胞转录组测序
• 免疫细胞转录组测序
• 神经细胞转录组测序
• 肿瘤细胞系转录组测序
• 原代细胞转录组测序
• 外泌体转录组测序
• 单细胞转录组测序

检测方法

• TRIzol法RNA提取：用于从细胞或组织中提取总RNA
• PolyA富集法：通过oligo(dT)磁珠捕获mRNA
• rRNA去除法：使用探针去除核糖体RNA
• SMARTer文库构建：基于模板转换的cDNA合成技术
• Illumina测序：采用边合成边测序原理
• FastQC质控：评估原始测序数据质量
• Hisat2比对：将测序reads映射到参考基因组
• StringTie组装：重构转录本结构
• DESeq2差异分析：基于负二项分布的差异表达统计
• ASprofile剪接分析：检测可变剪接事件
• CIRI2 circRNA预测：识别环状RNA分子
• miRDeep2分析：预测新型miRNA及其靶基因
• WGCNA共表达网络：构建基因调控网络
• GSEA富集分析：评估基因集富集程度
• STAR-Fusion检测：识别基因融合事件

检测仪器

• Nanodrop分光光度计
• Agilent 2100生物分析仪
• Qubit荧光定量仪
• Thermomixer混匀仪
• 离心机
• PCR仪
• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• Illumina NextSeq 550
• Covaris超声破碎仪
• 磁力架
• 恒温金属浴
• 电泳仪
• 凝胶成像系统
• 超低温冰箱

了解中析

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