单细胞转录组实验

信息概要

单细胞转录组测序是一种高通量技术，能够在单个细胞水平上解析基因表达谱，揭示细胞异质性和功能多样性。

该技术广泛应用于发育生物学、肿瘤微环境、免疫学及神经科学等领域，为精准医学和基础研究提供关键数据支持。

检测服务涵盖样本制备、文库构建、测序和生物信息学分析全流程，确保数据准确性和可重复性。

检测项目

• 细胞捕获效率评估
• 基因检出数统计
• UMI计数分布分析
• 线粒体基因占比检测
• 核糖体基因占比检测
• 细胞周期阶段判定
• 双细胞率计算
• 批次效应评估
• 基因表达丰度定量
• 差异表达基因分析
• 细胞亚群聚类分析
• 标志基因富集分析
• 细胞类型注释
• 轨迹推断分析
• 转录因子调控网络构建
• 细胞间通讯分析
• 可变剪接事件检测
• 新转录本发现
• 突变位点检测
• 拷贝数变异分析

检测范围

• 外周血单个核细胞
• 肿瘤组织浸润细胞
• 干细胞与祖细胞
• 神经元与胶质细胞
• 免疫细胞亚群
• 内皮细胞
• 上皮细胞
• 成纤维细胞
• 生殖细胞
• 胚胎发育细胞
• 器官特异性细胞
• 循环肿瘤细胞
• 微生物感染宿主细胞
• 药物处理样本细胞
• 基因编辑修饰细胞
• 类器官培养细胞
• 病理切片分离细胞
• 冷冻保存样本细胞
• 微流控分选细胞
• 激光显微切割细胞

检测方法

• 微流控芯片捕获技术：利用微孔或微滴系统分离单个细胞
• SMART-seq2：全长转录本扩增方法
• 10x Genomics Chromium：高通量液滴分选系统
• CEL-seq2：基于体外转录的扩增技术
• Drop-seq：微滴包裹单细胞标记技术
• scATAC-seq：单细胞染色质可及性检测
• STRT-seq：5'端转录本富集策略
• Quartz-seq：低偏倚扩增方法
• SPLiT-seq：组合标记测序技术
• sci-RNA-seq：组合索引策略
• MERFISH：空间转录组成像技术
• Seq-Well：微孔板捕获平台
• inDrop： hydrogel微滴封装系统
• TIVA-tag：活细胞转录组捕获技术
• Nad-seq：核糖体滞留RNA检测

检测仪器

• 10x Genomics Chromium Controller
• BD Rhapsody单细胞捕获系统
• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• Nanopore PromethION
• PacBio Sequel II
• Bio-Rad ddSEQ单细胞分离器
• Dolomite Bio Nadia
• Fluidigm C1单细胞制备系统
• Mission Bio Tapestri
• Singleron Matrix自动分选仪
• Agilent 4200 TapeStation
• Qubit 4.0荧光计
• Covaris M220超声破碎仪
• Beckman Coulter MoFlo Astrios

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