空间转录组测试

信息概要

空间转录组测试是一种先进的分子生物学技术，能够在组织原位水平上同时解析基因表达的空间分布信息。该技术通过结合高通量测序与空间位置标记，为研究者提供细胞或组织微环境中基因表达的准确图谱。

空间转录组检测的重要性在于，它能够揭示复杂生物组织中基因表达的异质性，帮助研究者理解发育、疾病进展、免疫微环境等关键生物学过程。与传统转录组相比，空间转录组保留了位置信息，为精准医学、肿瘤学、神经科学等领域提供了全新的研究视角。

本检测服务提供全面的空间转录组分析解决方案，包括样本处理、文库构建、测序服务和数据分析，适用于多种生物样本类型和研究需求。

检测项目

• 基因表达空间分布图谱
• 细胞类型空间定位分析
• 差异表达基因空间模式识别
• 组织区域特异性基因表达
• 空间可变基因检测
• 细胞-细胞相互作用分析
• 微环境特征基因表达
• 空间共表达网络构建
• 组织边界基因表达分析
• 空间转录组数据与单细胞数据整合
• 空间轨迹分析
• 空间差异剪切分析
• 空间基因集富集分析
• 空间突变检测
• 空间拷贝数变异分析
• 空间融合基因检测
• 空间外显子使用分析
• 空间新转录本发现
• 空间非编码RNA分析
• 空间转录组与蛋白质组数据关联分析

检测范围

• 人类组织样本
• 小鼠组织样本
• 大鼠组织样本
• 非人灵长类组织样本
• 植物组织样本
• 肿瘤组织样本
• 神经系统组织样本
• 心血管系统组织样本
• 免疫系统组织样本
• 消化系统组织样本
• 呼吸系统组织样本
• 泌尿系统组织样本
• 生殖系统组织样本
• 内分泌系统组织样本
• 骨骼肌肉系统组织样本
• 皮肤组织样本
• 胚胎发育组织样本
• 器官类器官样本
• 3D细胞培养样本
• 病理切片样本

检测方法

• Visium空间基因表达技术 - 基于寡核苷酸标记的组织切片空间转录组检测
• Slide-seq - 使用DNA条形码珠阵列捕获空间转录组信息
• MERFISH - 多重误差鲁棒荧光原位杂交技术实现单分子水平空间转录组检测
• seqFISH - 序贯荧光原位杂交技术实现高分辨率空间转录组分析
• STARmap - 组织内RNA的高通量多重成像技术
• HDST - 高分辨率空间转录组技术
• DBiT-seq - 微流控芯片整合的空间转录组技术
• Pixel-seq - 基于微孔阵列的空间转录组技术
• Spatial-ATAC-seq - 空间染色质可及性检测技术
• LCM-seq - 激光捕获显微切割结合RNA测序
• GeoMx DSP - 数字空间分析技术
• Xenium - 亚细胞分辨率原位分析技术
• CosMx - 单分子空间多组学成像技术
• Stereo-seq - 基于DNA纳米球阵列的空间转录组技术
• Nanostring GeoMX - 基于nCounter系统的空间多组学分析

检测仪器

• 10x Genomics Visium系统
• Nanostring GeoMX DSP系统
• MERFISH成像系统
• seqFISH成像系统
• STARmap成像系统
• BD Rhapsody系统
• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• Bionano Saphyr系统
• Fluidigm C1系统
• Leica激光显微切割系统
• Zeiss LSM 880共聚焦显微镜
• Thermo Fisher QuantStudio 7

了解中析

实验室仪器

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