宏基因组非靶向筛查检测

信息概要

宏基因组非靶向筛查检测是一种基于高通量测序技术的微生物组分析服务，通过对环境、临床或工业样本中的全部遗传物质进行无偏性测序，全面解析样本中微生物的组成、功能及多样性。

该检测的重要性在于能够突破传统培养法的局限性，直接检测不可培养或难培养的微生物，为疾病诊断、环境监测、生物安全评估等领域提供精准数据支持，助力科研与产业应用。

本服务涵盖DNA/RNA提取、文库构建、高通量测序及生物信息学分析全流程，可检测细菌、真菌、病毒、古菌等所有微生物类群。

检测项目

• 微生物群落α多样性分析
• 微生物群落β多样性分析
• 物种组成相对丰度检测
• 核心微生物组鉴定
• 病原微生物筛查
• 抗生素抗性基因分析
• 毒力因子基因检测
• 代谢功能预测分析
• 微生物间互作网络构建
• 环境因子关联分析
• 差异物种生物标志物筛选
• 微生物基因组组装
• 病毒基因组注释
• 移动遗传元件分析
• 噬菌体-宿主关系预测
• 微生物溯源追踪
• 环境适应性基因检测
• 生物膜形成相关基因分析
• 微生物休眠与复苏标记检测
• 微生物与环境污染物降解潜力评估

检测范围

• 人体微生物组（肠道/口腔/皮肤等）
• 环境微生物组（土壤/水体/空气）
• 工业微生物组（发酵/生产环境）
• 农业微生物组（根系/作物/肥料）
• 畜牧微生物组（饲料/粪便/畜体）
• 极端环境微生物组（高温/高盐/强酸）
• 海洋微生物组
• 极地微生物组
• 临床感染样本
• 食品微生物污染
• 药品微生物限度
• 化妆品微生物检测
• 医疗器械生物膜
• 建筑环境微生物
• 文物保存微生物
• 废水处理系统
• 油气田微生物
• 矿山微生物群落
• 太空环境微生物
• 古生物样本微生物

检测方法

• 16S/18S rRNA基因测序：针对原核/真核微生物保守区扩增测序
• ITS区域测序：真菌特异性间隔转录区分析
• 全基因组shotgun测序：直接对片段化DNA进行无偏性测序
• 宏转录组测序：检测活跃表达的微生物基因
• 宏病毒组测序：特异性富集病毒颗粒进行测序
• 单细胞基因组测序：对不可培养微生物进行单细胞分离测序
• 长读长测序技术：利用纳米孔/光学图谱提升组装效果
• 稳定同位素探针技术：标记活性微生物DNA
• 荧光原位杂交：结合显微观察验证微生物分布
• qPCR绝对定量：对关键微生物进行准确定量
• 质谱蛋白组学：补充微生物功能活性数据
• 代谢组学分析：检测微生物代谢产物
• CRISPR阵列分析：追踪微生物株系水平差异
• 表观基因组测序：检测微生物DNA修饰模式
• 流式细胞分选：物理分离特定微生物群体

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
• BGISEQ-500
• Qubit荧光定量仪
• Agilent 4200 TapeStation
• Covaris M220超声破碎仪
• Beckman Coulter MoFlo XDP
• NanoDrop超微量分光光度计
• Eppendorf Mastercycler PCR仪
• MiSeq FGx微生物鉴定系统
• BD FACSAria III流式细胞仪
• Zeiss LSM 880共聚焦显微镜
• Maldi Biotyper质谱系统

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