RNA非靶向测序检测（病原鉴定）

信息概要

RNA非靶向测序检测（病原鉴定）是一种基于高通量测序技术的病原体检测方法，能够全面、快速地识别样本中的未知病原体，包括病毒、细菌、真菌和寄生虫等。

该检测通过提取样本中的总RNA，进行文库构建和测序，再通过生物信息学分析比对数据库，实现对病原体的精准鉴定。其重要性在于能够发现新发、突发或罕见病原体，为临床诊断、流行病学调查和公共卫生防控提供关键技术支持。

RNA非靶向测序检测适用于临床样本、环境样本和动物样本等多种类型，具有高灵敏度、广覆盖和无需预设靶标的特点，是病原体检测领域的重要工具。

检测项目

• 病毒基因组检测
• 细菌基因组检测
• 真菌基因组检测
• 寄生虫基因组检测
• 病原体载量定量
• 病原体变异分析
• 新发病原体筛查
• 混合感染鉴定
• 耐药基因检测
• 毒力因子分析
• 宿主免疫反应相关基因检测
• 病原体分型
• 进化树分析
• 转录组分析
• 基因表达谱分析
• 病原体与宿主互作研究
• 环境病原体监测
• 食品安全相关病原体检测
• 动物疫病病原体检测
• 生物安全风险评估

检测范围

• 呼吸道病毒
• 肠道病毒
• 肝炎病毒
• 疱疹病毒
• 逆转录病毒
• 革兰氏阳性菌
• 革兰氏阴性菌
• 分支杆菌
• 螺旋体
• 支原体
• 衣原体
• 立克次体
• 酵母菌
• 霉菌
• 原虫
• 蠕虫
• 节肢动物媒介病原体
• 植物病原体
• 水产动物病原体
• 人畜共患病病原体

检测方法

• 总RNA提取：使用试剂盒法提取样本中的总RNA
• RNA质量检测：通过电泳或生物分析仪检测RNA完整性
• rRNA去除：使用探针杂交法去除核糖体RNA
• 文库构建：采用随机引物法进行cDNA合成和文库制备
• 片段筛选：通过磁珠法筛选合适大小的文库片段
• 文库定量：使用qPCR法准确测定文库浓度
• 高通量测序：在测序仪上进行双端测序
• 原始数据质控：使用FastQC进行测序数据质量评估
• 低质量序列过滤：去除低质量和接头序列
• 宿主序列去除：比对宿主基因组去除宿主来源序列
• 病原体序列比对：使用BLAST等工具比对病原体数据库
• 基因组组装：对病原体序列进行de novo组装
• 变异分析：识别病原体基因组中的突变位点
• 进化分析：构建系统发育树分析病原体进化关系
• 报告生成：整合分析结果生成检测报告

检测仪器

• Nanodrop分光光度计
• Qubit荧光定量仪
• Bioanalyzer生物分析仪
• 离心机
• PCR仪
• 磁力架
• 恒温金属浴
• 微量移液器
• 超净工作台
• Illumina测序仪
• Ion Torrent测序仪
• PacBio测序仪
• Oxford Nanopore测序仪
• 生物安全柜
• 超低温冰箱

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