转录组测序实验
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信息概要
转录组测序是一种高通量测序技术,通过对细胞或组织中的RNA进行测序,全面分析基因表达水平、可变剪接、新转录本发现等。该技术广泛应用于生命科学研究、疾病机制探索、生物标志物发现等领域。
转录组测序检测的重要性在于能够揭示基因表达的动态变化,帮助研究者理解生物过程的调控机制,为疾病诊断、药物开发等提供关键数据支持。我们的检测服务确保数据准确可靠,满足科研和临床需求。
检测项目
- 基因表达水平分析
- 差异表达基因筛选
- 可变剪接分析
- 新转录本预测
- 非编码RNA分析
- 基因融合检测
- SNP和突变分析
- 功能富集分析
- 通路分析
- 共表达网络构建
- 样本间相关性分析
- 转录因子调控分析
- UTR分析
- RNA编辑分析
- 基因结构优化
- 样本质量控制
- 数据标准化处理
- 批次效应校正
- 多组学数据整合
- 定制化分析报告
检测范围
- mRNA测序
- small RNA测序
- lncRNA测序
- circRNA测序
- 全转录组测序
- 单细胞转录组测序
- 空间转录组测序
- 微生物转录组测序
- 植物转录组测序
- 动物转录组测序
- 人类转录组测序
- 疾病模型转录组测序
- 药物处理转录组测序
- 发育阶段转录组测序
- 环境应激转录组测序
- 肿瘤转录组测序
- 免疫转录组测序
- 神经转录组测序
- 代谢转录组测序
- 表观转录组测序
检测方法
- RNA提取与纯化:使用柱式法或磁珠法提取高质量RNA
- RNA完整性检测:通过Agilent Bioanalyzer评估RNA质量
- 文库构建:采用链特异性建库方法
- polyA富集:用于mRNA测序
- rRNA去除:用于非polyA RNA测序
- 片段化:将RNA随机打断至适宜长度
- 逆转录:合成cDNA第一链和第二链
- 末端修复:修复DNA片段末端
- 加A尾:为连接接头做准备
- 接头连接:添加测序接头和barcode
- PCR扩增:富集文库
- 文库定量:通过qPCR准确测定文库浓度
- 文库质控:检测文库片段分布
- 上机测序:使用Illumina平台进行高通量测序
- 数据质控:对原始数据进行质量评估
检测仪器
- Illumina NovaSeq 6000
- Illumina HiSeq X Ten
- Illumina NextSeq 550
- Illumina MiSeq
- Agilent 2100 Bioanalyzer
- Qubit Fluorometer
- Nanodrop Spectrophotometer
- Covaris S220
- Thermal Cycler
- Centrifuge
- Magnetic Stand
- PCR Workstation
- Electrophoresis System
- Microplate Reader
- Liquid Handling Robot
了解中析