转录组测序实验

信息概要

转录组测序是一种高通量测序技术，通过对细胞或组织中的RNA进行测序，全面分析基因表达水平、可变剪接、新转录本发现等。该技术广泛应用于生命科学研究、疾病机制探索、生物标志物发现等领域。

转录组测序检测的重要性在于能够揭示基因表达的动态变化，帮助研究者理解生物过程的调控机制，为疾病诊断、药物开发等提供关键数据支持。我们的检测服务确保数据准确可靠，满足科研和临床需求。

检测项目

• 基因表达水平分析
• 差异表达基因筛选
• 可变剪接分析
• 新转录本预测
• 非编码RNA分析
• 基因融合检测
• SNP和突变分析
• 功能富集分析
• 通路分析
• 共表达网络构建
• 样本间相关性分析
• 转录因子调控分析
• UTR分析
• RNA编辑分析
• 基因结构优化
• 样本质量控制
• 数据标准化处理
• 批次效应校正
• 多组学数据整合
• 定制化分析报告

检测范围

• mRNA测序
• small RNA测序
• lncRNA测序
• circRNA测序
• 全转录组测序
• 单细胞转录组测序
• 空间转录组测序
• 微生物转录组测序
• 植物转录组测序
• 动物转录组测序
• 人类转录组测序
• 疾病模型转录组测序
• 药物处理转录组测序
• 发育阶段转录组测序
• 环境应激转录组测序
• 肿瘤转录组测序
• 免疫转录组测序
• 神经转录组测序
• 代谢转录组测序
• 表观转录组测序

检测方法

• RNA提取与纯化：使用柱式法或磁珠法提取高质量RNA
• RNA完整性检测：通过Agilent Bioanalyzer评估RNA质量
• 文库构建：采用链特异性建库方法
• polyA富集：用于mRNA测序
• rRNA去除：用于非polyA RNA测序
• 片段化：将RNA随机打断至适宜长度
• 逆转录：合成cDNA第一链和第二链
• 末端修复：修复DNA片段末端
• 加A尾：为连接接头做准备
• 接头连接：添加测序接头和barcode
• PCR扩增：富集文库
• 文库定量：通过qPCR准确测定文库浓度
• 文库质控：检测文库片段分布
• 上机测序：使用Illumina平台进行高通量测序
• 数据质控：对原始数据进行质量评估

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• Illumina NextSeq 550
• Illumina MiSeq
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Qubit Fluorometer
• Nanodrop Spectrophotometer
• Covaris S220
• Thermal Cycler
• Centrifuge
• Magnetic Stand
• PCR Workstation
• Electrophoresis System
• Microplate Reader
• Liquid Handling Robot