单细胞转录组检测

信息概要

单细胞转录组检测是一种高通量测序技术，能够在单个细胞水平上解析基因表达谱，揭示细胞异质性、功能状态及发育轨迹。该技术广泛应用于肿瘤研究、免疫学、神经科学、发育生物学等领域，为精准医学和基础研究提供关键数据支持。

单细胞转录组检测的重要性在于其能够突破传统批量测序的局限，精准识别稀有细胞类型、解析细胞间差异，并挖掘潜在生物标志物或治疗靶点。第三方检测机构通过标准化流程、分析平台和严格质控，为客户提供可靠的单细胞测序服务。

检测项目

• 单细胞捕获效率评估
• 细胞活性检测
• mRNA文库构建质量评估
• 基因检出数统计
• UMI计数分布分析
• 线粒体基因占比检测
• 核糖体基因占比检测
• 双细胞率计算
• 批次效应评估
• 基因表达矩阵生成
• 细胞聚类分析
• 差异表达基因鉴定
• 细胞类型注释
• 拟时序分析
• 转录因子调控网络预测
• 细胞周期阶段判定
• 细胞间通讯分析
• 功能富集分析
• 突变检测（SNV/Indel）
• 可变剪切事件分析

检测范围

• 外周血单个核细胞
• 肿瘤浸润淋巴细胞
• 循环肿瘤细胞
• 神经元细胞
• 干细胞
• 上皮细胞
• 内皮细胞
• 成纤维细胞
• 巨噬细胞
• T细胞亚群
• B细胞亚群
• NK细胞
• 树突状细胞
• 肿瘤组织细胞
• 类器官细胞
• 胚胎发育细胞
• 脑脊液细胞
• 肺泡灌洗液细胞
• 肠道上皮细胞
• 肝实质细胞

检测方法

• 微流控单细胞分选（基于液滴封装技术）
• 磁珠分选（MACS）
• 流式细胞分选（FACS）
• SMART-seq2（全长转录本检测）
• 10x Genomics Chromium系统
• Drop-seq（微滴单细胞测序）
• CEL-seq2（线性扩增技术）
• SCRB-seq（组合索引技术）
• inDrops（微滴包裹单细胞）
• 单细胞ATAC-seq（染色质可及性检测）
• 单细胞免疫组库测序
• 单细胞多组学联合分析
• 单细胞空间转录组技术
• 单细胞CNV检测
• 单细胞甲基化测序

检测仪器

• 10x Genomics Chromium Controller
• BD Rhapsody系统
• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• Nanopore PromethION
• PacBio Sequel II
• Fluidigm C1系统
• Bio-Rad ddSEQ
• Dolomite Bio Nadia
• Mission Bio Tapestri
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Qubit荧光定量仪
• QuantStudio实时PCR系统
• Beckman Coulter MoFlo Astrios
• Miltenyi Biotec MACSQuant

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