SSR标记筛选

信息概要

SSR标记筛选是一种基于微卫星标记的分子检测技术，广泛应用于遗传多样性分析、品种鉴定、亲子关系验证等领域。该技术通过检测基因组中特定的简单序列重复（SSR）位点，提供高分辨率和可重复的遗传信息。第三方检测机构通过的SSR标记筛选服务，为客户提供准确、可靠的检测数据，帮助其在科研、育种、司法鉴定等场景中做出科学决策。检测的重要性在于其能够为遗传研究、品种保护、质量控制等提供关键依据，确保数据的性和可追溯性。

检测项目

• SSR位点数量分析
• 等位基因频率计算
• 多态性信息含量（PIC）分析
• 遗传距离评估
• 群体遗传结构分析
• 杂合度检测
• 纯合度检测
• 亲子关系验证
• 品种真实性鉴定
• 遗传相似性分析
• 基因型频率分布
• Hardy-Weinberg平衡检验
• 连锁不平衡分析
• 群体分化系数（Fst）计算
• 近交系数分析
• 有效等位基因数计算
• 遗传多样性指数分析
• 分子方差分析（AMOVA）
• 主成分分析（PCA）
• 聚类分析（UPGMA或NJ树）

检测范围

• 农作物品种鉴定
• 林木遗传多样性分析
• 畜禽亲子关系验证
• 水产种质资源评估
• 微生物菌株分型
• 药用植物品种鉴别
• 果蔬品种真实性检测
• 花卉品种鉴定
• 野生植物资源调查
• 濒危物种保护遗传学
• 转基因作物检测
• 种子纯度检测
• 动物种群遗传结构分析
• 昆虫种群遗传学研究
• 海洋生物遗传多样性
• 古DNA遗传分析
• 法医物证鉴定
• 人类遗传病研究
• 家系溯源分析
• 生态遗传学研究

检测方法

• PCR扩增：通过聚合酶链式反应扩增目标SSR位点
• 毛细管电泳：分离并检测荧光标记的SSR片段
• 荧光标记：使用荧光染料标记引物或dNTPs
• 基因分型：根据片段大小确定等位基因
• 聚丙烯酰胺凝胶电泳：传统SSR检测方法
• 琼脂糖凝胶电泳：快速筛查SSR扩增产物
• 高通量测序：大规模SSR位点分析
• 多重PCR：同时扩增多个SSR位点
• 银染检测：非荧光SSR片段可视化
• 微卫星富集：从基因组中分离SSR序列
• 生物信息学分析：SSR位点预测与引物设计
• 数据归一化：不同批次数据的标准化处理
• 质量控制：检测过程中的质量监控
• 统计分析：遗传参数计算与假设检验
• 可视化呈现：结果图表生成与解读

检测仪器

• ABI 3500遗传分析仪
• QIAxcel Advanced系统
• Bio-Rad CFX96实时PCR仪
• Thermo Fisher QuantStudio实时PCR系统
• Illumina MiSeq测序仪
• Agilent 2100生物分析仪
• Beckman Coulter CEQ 8000
• Eppendorf Mastercycler PCR仪
• Bio-Rad Gel Doc XR+成像系统
• Thermo Scientific NanoDrop分光光度计
• Qiagen Rotor-Gene Q实时PCR仪
• Applied Biosystems Veriti热循环仪
• LabChip GX Touch核酸分析仪
• Beckman Coulter Biomek液体处理项目合作单位
• Thermo Fisher KingFisher核酸纯化系统

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