甲基化修饰检测

信息概要

甲基化修饰检测是一种通过分析DNA或RNA上的甲基化修饰来研究基因表达调控、表观遗传学变化的重要技术。该检测在疾病诊断、肿瘤筛查、发育生物学和药物研发等领域具有广泛应用价值。通过精准检测甲基化水平，可以为临床诊断和科学研究提供关键数据支持。

甲基化修饰检测的重要性在于其能够揭示基因沉默或激活的机制，帮助识别疾病相关的表观遗传标记。例如，肿瘤中特定基因的异常甲基化模式可作为早期诊断的生物标志物。此外，甲基化检测还能用于评估环境因素对基因表达的影响，为个性化医疗提供依据。

检测项目

• 全基因组甲基化水平检测
• 启动子区域甲基化分析
• CpG岛甲基化状态检测
• 基因特异性甲基化定量
• 差异甲基化区域(DMR)鉴定
• 甲基化单倍型分析
• 羟甲基化修饰检测
• 甲基化敏感限制酶消化分析
• 甲基化特异性PCR(MSP)
• 亚硫酸氢盐测序(Bisulfite sequencing)
• 甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)
• 甲基化芯片分析
• 单细胞甲基化分析
• 循环肿瘤DNA甲基化检测
• 组织特异性甲基化图谱
• 发育阶段甲基化动态监测
• 环境暴露相关甲基化变化
• 药物反应甲基化标志物检测
• 衰老相关甲基化时钟分析
• 跨代甲基化遗传研究

检测范围

• 人类基因组DNA甲基化
• 小鼠基因组DNA甲基化
• 大鼠基因组DNA甲基化
• 植物基因组DNA甲基化
• 微生物基因组DNA甲基化
• 肿瘤组织DNA甲基化
• 血液游离DNA甲基化
• 唾液DNA甲基化
• 尿液DNA甲基化
• 脑组织DNA甲基化
• 胎盘组织DNA甲基化
• 精子DNA甲基化
• 卵子DNA甲基化
• 胚胎干细胞DNA甲基化
• 诱导多能干细胞DNA甲基化
• 外周血单个核细胞DNA甲基化
• 肿瘤细胞系DNA甲基化
• 原代培养细胞DNA甲基化
• 古DNA甲基化
• 环境DNA甲基化

检测方法

• 亚硫酸氢盐测序：通过亚硫酸氢盐处理将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶，保留甲基化位点
• 甲基化特异性PCR：使用针对甲基化和非甲基化DNA序列的特异性引物进行扩增
• 焦磷酸测序：定量分析亚硫酸氢盐转化后的序列，准确测定单个CpG位点的甲基化水平
• 甲基化敏感限制酶分析：利用对甲基化状态敏感的限制酶消化DNA后进行PCR分析
• 甲基化DNA免疫共沉淀：使用抗5-甲基胞嘧啶抗体富集甲基化DNA片段
• 全基因组甲基化芯片：高通量检测全基因组范围内数十万个CpG位点的甲基化状态
• 简化代表性亚硫酸氢盐测序：对基因组代表性片段进行亚硫酸氢盐测序，降低成本
• 单细胞甲基化测序：在单细胞水平分析甲基化图谱
• 纳米孔测序：通过直接测序检测甲基化修饰，无需亚硫酸氢盐转化
• 甲基化敏感单核苷酸引物延伸：通过引物延伸反应定量单个CpG位点的甲基化水平
• 甲基化特异性高分辨率熔解曲线分析：基于熔解曲线差异区分甲基化和非甲基化DNA
• 甲基化特异性数字PCR：绝对定量特定甲基化DNA分子的数量
• 甲基化特异性质谱分析：通过质谱检测亚硫酸氢盐转化后的质量变化
• 甲基化特异性荧光检测：使用荧光标记探针检测甲基化状态
• 甲基化特异性下一代测序：高通量测序技术与甲基化分析相结合

检测仪器

• Illumina HiSeq测序仪
• Illumina NovaSeq测序仪
• Illumina MiSeq测序仪
• Ion Torrent测序仪
• PacBio Sequel测序仪
• Oxford Nanopore测序仪
• PyroMark Q96 ID焦磷酸测序仪
• QuantStudio实时PCR仪
• Bio-Rad CFX实时PCR仪
• Agilent 2100生物分析仪
• Nanodrop分光光度计
• Qubit荧光定量仪
• Covaris超声破碎仪
• Thermo Fisher质谱仪
• Bio-Rad ddPCR系统

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