小鼠主动脉夹层表观遗传实验

信息概要

• 产品介绍：小鼠主动脉夹层表观遗传实验提供全面的表观遗传标记检测服务，包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性等分析，专注于揭示疾病机制。
• 检测重要性：通过表观遗传学分析，有助于理解主动脉夹层的发病过程，为早期诊断、治疗策略和药物开发提供科学依据，提升疾病研究的深度和准确性。
• 检测信息概括：采用高通量测序、分子生物学和生物信息学技术，确保数据可靠性和重复性，覆盖从样本制备到数据解读的全流程服务。

检测项目

• DNA甲基化整体水平
• 特定基因DNA甲基化
• 组蛋白H3乙酰化
• 组蛋白H3K4me3修饰
• 组蛋白H3K27me3修饰
• 组蛋白H3K9me3修饰
• 染色质免疫沉淀测序
• RNA测序表达分析
• 微小RNA表达
• 长非编码RNA表达
• 环状RNA表达
• DNA羟甲基化
• 染色质构象
• 转录因子结合位点
• 增强子活性
• 启动子甲基化状态
• 基因体甲基化
• 全基因组亚硫酸氢盐测序
• 降低代表性亚硫酸氢盐测序
• 甲基化DNA免疫沉淀
• 组蛋白修饰ChIP-seq
• ATAC-seq
• DNase-seq
• FAIRE-seq
• Hi-C
• 甲基化特异性PCR
• 焦磷酸测序
• 免疫组织化学
• Western blot
• 实时荧光定量PCR
• 染色质可及性分析
• 非编码RNA调控
• 表观遗传变异筛查
• 基因沉默标记检测
• 组蛋白磷酸化
• 组蛋白泛素化
• DNA修复相关表观标记
• 环境因素响应分析
• 发育阶段表观变化
• 衰老相关表观修饰

检测范围

• 全基因组DNA甲基化
• 靶向DNA甲基化
• 组蛋白乙酰化
• 组蛋白甲基化
• 组蛋白磷酸化
• 组蛋白泛素化
• 染色质可及性
• 非编码RNA表达
• 微小RNA表达
• 长非编码RNA表达
• 环状RNA表达
• DNA羟甲基化
• 染色质交互
• 转录因子结合
• 增强子鉴定
• 启动子分析
• 基因沉默标记
• 表观遗传时钟
• 甲基化位点验证
• 组蛋白修饰定量
• 全基因组关联研究
• 表观基因组学
• 单细胞表观遗传学
• 空间表观遗传学
• 动态表观遗传变化
• 疾病相关表观遗传变异
• 药物响应表观遗传标记
• 环境因素表观遗传影响
• 发育表观遗传学
• 衰老表观遗传学
• 炎症反应表观调控
• 代谢表观遗传学
• 心血管表观遗传学
• 肿瘤表观遗传学
• 神经表观遗传学
• 免疫表观遗传学
• 表观遗传治疗响应
• 表观遗传生物标志物
• 表观遗传风险预测

检测方法

• ChIP-seq：染色质免疫沉淀测序，用于检测蛋白质-DNA相互作用和组蛋白修饰。
• RNA-seq：RNA测序，用于全转录组分析和高通量基因表达 profiling。
• WGBS：全基因组亚硫酸氢盐测序，用于全基因组DNA甲基化位点的高分辨率检测。
• RRBS：降低代表性亚硫酸氢盐测序，用于靶向和率的甲基化分析。
• MeDIP：甲基化DNA免疫沉淀，用于富集和检测甲基化DNA区域。
• ATAC-seq： assay for transposase-accessible chromatin with sequencing, 用于染色质可及性分析。
• DNase-seq：DNase I hypersensitive sites sequencing, 用于鉴定开放染色质区域。
• FAIRE-seq： formaldehyde-assisted isolation of regulatory elements sequencing, 用于识别调控元件。
• Hi-C：用于三维基因组结构和染色质交互分析。
• Methylation-specific PCR：用于特定基因或区域的甲基化状态检测。
• Bisulfite sequencing：通过亚硫酸氢盐处理测序，用于DNA甲基化定量。
• Pyrosequencing：焦磷酸测序，用于高通量甲基化位点定量。
• Immunohistochemistry：免疫组织化学，用于组织切片中蛋白和修饰的定位。
• Western blot：Western印迹，用于蛋白表达和翻译后修饰的检测。
• qPCR：实时荧光定量PCR，用于基因表达和甲基化的快速定量。
• Microarray：芯片技术，用于基因表达或甲基化的高通量筛查。
• LC-MS/MS：液相色谱-质谱联用，用于组蛋白修饰的准确定量。
• ChIP-qPCR：染色质免疫沉淀后qPCR，用于特定基因组区域的验证。
• 4C： circular chromosome conformation capture, 用于特定位点的染色质交互分析。
• 5C： carbon copy chromosome conformation capture, 用于中等规模染色质交互 mapping。
• Cut&Run： cleavage under targets and release using nuclease, 用于ChIP替代方法。
• Cut&Tag： cleavage under targets and tagmentation, 类似Cut&Run，用于蛋白质-DNA相互作用。
• OxBS-seq：氧化亚硫酸氢盐测序，用于区分5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。
• TAB-seq： TET-assisted bisulfite sequencing, 用于5hmC的检测和定量。
• hMeDIP：羟甲基化DNA免疫沉淀，用于5hmC富集和分析。
• MethylCap：甲基化捕获测序，用于甲基化DNA的靶向测序。
• SCENIC： single-cell regulatory network inference, 用于单细胞调控网络推断。
• DNase I footprinting：用于转录因子结合位点的精细 mapping。
• ChIPmentation：组合ChIP和tagmentation，用于文库制备和测序。
• CUT&RUN：如上所述，用于低输入样本的蛋白质-DNA相互作用分析。

检测仪器

• Illumina NovaSeq
• Illumina HiSeq
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Qubit Fluorometer
• Real-time PCR System
• Nanodrop Spectrophotometer
• Thermal Cycler
• Centrifuge
• Microscope
• Flow Cytometer
• Mass Spectrometer
• Chromatography System
• Electrophoresis System
• Microarray Scanner
• Cell Sorter
• Incubator
• Shaker
• Autoclave
• Laminar Flow Hood
• Liquid Handler