临床分离物PFGE实验

信息概要

• 临床分离物PFGE（脉冲场凝胶电泳）实验是一种用于细菌分型和分子流行病学调查的高分辨率DNA指纹技术，通过分析细菌基因组的大片段DNA来追踪感染源和传播路径。
• 该检测服务由第三方检测机构提供，确保结果客观准确，适用于医院、疾控中心和科研机构，帮助监测疫情爆发、评估控制措施和指导临床治疗。
• 检测的重要性在于它能识别细菌菌株间的遗传相关性，辅助 outbreak 调查和抗生素耐药性研究，从而提升公共卫生响应能力和感染控制水平。

检测项目

• 金黄色葡萄球菌PFGE分析
• 大肠杆菌PFGE分析
• 肺炎克雷伯菌PFGE分析
• 铜绿假单胞菌PFGE分析
• 肠球菌属PFGE分析
• 沙门氏菌属PFGE分析
• 志贺氏菌属PFGE分析
• 李斯特菌属PFGE分析
• 弯曲菌属PFGE分析
• 霍乱弧菌PFGE分析
• 结核分支杆菌PFGE分析
• 鲍曼不动杆菌PFGE分析
• 嗜血杆菌属PFGE分析
• 链球菌属PFGE分析
• 奈瑟菌属PFGE分析
• 耶尔森菌属PFGE分析
• 普罗维登斯菌属PFGE分析
• 摩根菌属PFGE分析
• 柠檬酸杆菌属PFGE分析
• 爱德华菌属PFGE分析
• 变形杆菌属PFGE分析
• 沙雷菌属PFGE分析
• 克雷伯菌属其他种PFGE分析
• 肠杆菌属PFGE分析
• 不动杆菌属其他种PFGE分析
• 假单胞菌属其他种PFGE分析
• 芽孢杆菌属PFGE分析
• 梭菌属PFGE分析
• 诺卡菌属PFGE分析
• 放线菌属PFGE分析

检测范围

• 革兰氏阳性球菌
• 革兰氏阴性杆菌
• 需氧菌
• 厌氧菌
• 兼性厌氧菌
• 肠道病原菌
• 呼吸道病原菌
• 血液感染病原菌
• 皮肤和软组织感染病原菌
• 泌尿生殖道感染病原菌
• 中枢神经系统感染病原菌
• 机会性致病菌
• 社区获得性病原菌
• 医院获得性病原菌
• 食源性病原菌
• 水源性病原菌
• 人畜共患病原菌
• 抗生素耐药菌
• 多重耐药菌
• 广泛耐药菌
• 产酶菌
• 毒素产生菌
• 生物膜形成菌
• 快速生长菌
• 慢生长菌
• 嗜温菌
• 嗜冷菌
• 嗜热菌
• 极端环境菌
• 临床常见分离菌

检测方法

• 细胞培养和分离：通过培养基培养临床样本中的细菌，获得纯分离物。
• DNA提取：使用酚-氯仿法或商业试剂盒提取细菌基因组DNA。
• DNA浓度测定：通过分光光度计测量DNA浓度和纯度。
• 限制性内切酶酶切：使用稀有切割酶如NotI或SmaI对DNA进行酶切。
• 脉冲场凝胶电泳：在特定条件下运行电泳，分离大片段DNA。
• 凝胶染色：使用溴化乙锭或SYBR Green对凝胶进行染色。
• 凝胶成像：通过紫外透射仪捕获DNA条带图像。
• 图像分析：使用软件如BioNumerics分析条带模式。
• 聚类分析：基于条带相似性进行菌株分群。
• 标准菌株对照：包括标准菌株以确保实验一致性。
• 质量控制：实施内部质量控制措施，如重复实验。
• 数据分析：生成指纹图谱和相似性矩阵。
• 结果解释：根据聚类结果判断菌株相关性。
• 报告生成：编写详细检测报告，包括图谱和结论。
• 方法验证：定期验证方法的准确性和重复性。
• 样本预处理：对临床样本进行初步处理和去污染。
• 细菌鉴定：通过生化或分子方法确认细菌种类。
• 抗生素敏感性测试：辅助评估耐药性模式。
• 环境监测：应用于环境样本的PFGE分析。
• 流行病学调查：整合临床数据追踪传播链。

检测仪器

• 脉冲场凝胶电泳仪
• 凝胶成像系统
• 紫外透射仪
• 分光光度计
• 离心机
• 恒温水浴锅
• 电泳槽
• 电源供应器
• 微量移液器
• PCR仪
• 酶标仪
• 生物安全柜
• 培养箱
• 振荡器
• 冰箱和冷冻柜