分型样本脉冲场凝胶电泳测试

信息概要

• 分型样本脉冲场凝胶电泳（PFGE）是一种高级分子生物学技术，用于分离大片段DNA，广泛应用于微生物分型、基因型分析和流行病学调查。
• 检测的重要性在于能够提供准确的DNA指纹图谱，帮助识别疾病爆发源、追踪病原体传播、确保食品安全和医疗质量控制，从而支持公共卫生决策和感染控制。
• 检测信息概括：该服务包括样品处理、电泳运行、图像捕获和数据分析，提供标准化、高分辨率的结果，适用于多种生物样本。

检测项目

• DNA片段大小分析
• Band模式评估
• 相似性指数计算
• 迁移距离测量
• 电泳运行时间监控
• 电压设置优化
• 温度控制参数
• 酶切效率检验
• 图像清晰度评估
• 分辨率测定
• 重复性测试
• 准确性验证
• 特异性分析
• 灵敏度检测
• 背景噪声水平
• Band强度量化
• DNA浓度测定
• 纯度评估
• 分子量标准比较
• 运行缓冲液pH值
• 凝胶浓度优化
• 电场强度调整
• 脉冲时间设置
• 角度参数配置
• 运行时间记录
• 样品加载量控制
• 染色方法应用
• 脱色效率检查
• 成像条件标准化
• 数据分析算法执行

检测范围

• 细菌
• 酵母
• 霉菌
• 病毒
• 质粒DNA
• 染色体DNA
• Staphylococcus aureus
• Escherichia coli
• Salmonella enterica
• Listeria monocytogenes
• Campylobacter jejuni
• Pseudomonas aeruginosa
• Bacillus subtilis
• Mycobacterium tuberculosis
• Candida albicans
• Aspergillus fumigatus
• Hepatitis B virus
• HIV
• Influenza virus
• Streptococcus pneumoniae
• Clostridium difficile
• Enterococcus faecalis
• Klebsiella pneumoniae
• Proteus mirabilis
• Shigella sonnei
• Vibrio cholerae
• Legionella pneumophila
• Neisseria meningitidis
• Helicobacter pylori
• Cryptococcus neoformans

检测方法

• 样品制备：提取和纯化DNA样本，确保高质量输入。
• 酶切消化：使用限制性内切酶切割DNA，产生特定片段。
• 凝胶铸造：制备琼脂糖凝胶，优化浓度以分离大DNA。
• 样品加载：将处理后的DNA样本准确加入凝胶孔中。
• 电泳运行：在脉冲场条件下进行电泳，分离DNA片段。
• 电压优化：调整电压参数，以获得最佳分离效果。
• 温度控制：维持恒定温度 during run，确保一致性。
• 缓冲液更换：定期更换电泳缓冲液，防止降解。
• 染色过程：使用溴化乙锭或其他染料染色DNA bands。
• 脱色步骤：去除多余染料，提高图像对比度。
• 成像捕获：使用UV transilluminator捕获凝胶图像。
• 图像分析：通过软件分析band patterns，进行量化。
• 标准化：与分子量标准比较，校准片段大小。
• 相似性计算：计算样本间的相似性指数，用于分型。
• 模式匹配：将结果与数据库中的模式进行比对。
• 质量控制：实施严格QC措施，确保实验可靠性。
• 重复测试：进行技术重复，验证结果一致性。
• 数据解释：综合分析和解释电泳结果。
• 验证方法：使用PCR或其他技术交叉验证PFGE结果。
• 存储条件：优化样本和凝胶的存储，防止降解。

检测仪器

• 脉冲场凝胶电泳仪
• 电泳槽
• 电源供应器
• UV transilluminator
• 凝胶成像系统
• 离心机
• 水浴锅
• spectrophotometer
• 微量移液器
• 凝胶铸造托盘
• 电泳缓冲液 tank
• 样品加热块
• 酶切反应管
• 成像相机
• 数据分析软件