外泌体表观遗传实验

信息概要

• 外泌体表观遗传学检测服务是针对细胞外泌体（Exosome）所携带的表观遗传信息（如DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等）进行的高通量、高精度分析。该服务通过分离纯化外泌体，并运用多种尖端技术解析其表观遗传学特征，为疾病机制研究、生物标志物发现、药物开发及精准医疗提供关键数据支撑。检测的重要性在于，外泌体作为细胞间通信的重要载体，其表观遗传信息的变化能实时反映源细胞的生理病理状态，是极具潜力的无创诊断（液体活检）和预后评估工具。

检测项目

• 外泌体DNA全基因组甲基化测序（WGBS）
• 外泌体DNA靶向区域甲基化测序（例如：RRBS）
• 外泌体特异性甲基化位点验证（例如：Pyrosequencing）
• 外泌体组蛋白H3K4me3修饰检测
• 外泌体组蛋白H3K27me3修饰检测
• 外泌体组蛋白H3K9me3修饰检测
• 外泌体组蛋白H3K36me3修饰检测
• 外泌体组蛋白H3K27ac修饰检测
• 外泌体组蛋白H3K9ac修饰检测
• 外泌体组蛋白修饰全谱分析（ChIP-seq）
• 外泌体miRNA（microRNA）表达谱分析
• 外泌体circRNA（环状RNA）表达谱分析
• 外泌体lncRNA（长链非编码RNA）表达谱分析
• 外泌体piRNA（Piwi-interacting RNA）表达谱分析
• 外泌体snRNA（小核RNA）表达谱分析
• 外泌体snoRNA（小核仁RNA）表达谱分析
• 外泌体tRNA（转运RNA）衍生片段分析
• 外泌体RNA修饰检测（如m6A, m5C, A-to-I编辑）
• 外泌体RNA整体甲基化水平定量
• 外泌体特异性非编码RNA标志物验证（qRT-PCR）
• 外泌体染色质可及性分析（ATAC-seq）
• 外泌体蛋白-DNA相互作用分析（Cut&Tag）
• 外泌体整体DNA甲基化水平（5-mC%）定量
• 外泌体整体羟甲基化水平（5-hmC%）定量
• 外泌体特异性组蛋白修饰水平（ELISA/免疫印迹）
• 外泌体载体的miRNA-mRNA相互作用网络分析
• 外泌体表观遗传相关蛋白（如DNMTs, HDACs）表达水平
• 外泌体完整性及浓度检测（NTA）
• 外泌体特异性表面标志物检测（CD9, CD63, CD81等）
• 外泌体来源细胞追踪的表观遗传学分析

检测范围

• 血浆来源外泌体
• 血清来源外泌体
• 尿液来源外泌体
• 脑脊液来源外泌体
• 唾液来源外泌体
• 乳汁来源外泌体
• 腹水来源外泌体
• 胸水来源外泌体
• 精液来源外泌体
• 细胞培养上清液来源外泌体
• 肿瘤组织来源外泌体
• 神经细胞来源外泌体
• 免疫细胞来源外泌体（如T细胞外泌体）
• 干细胞来源外泌体（如MSCs外泌体）
• 内皮细胞来源外泌体
• 上皮细胞来源外泌体
• 心肌细胞来源外泌体
• 肝细胞来源外泌体
• 肾细胞来源外泌体
• 血小板来源外泌体
• 细菌来源外泌体样囊泡
• 植物来源外泌体样纳米颗粒
• 病毒修饰的宿主细胞外泌体
• 工程化改造的外泌体（如载药外泌体）
• 不同大小范围的外泌体亚群（如小外泌体、大外泌体）
• 不同密度范围的外泌体亚群
• 不同表面标志物阳性的外泌体亚群
• 来自不同疾病模型的外泌体（如癌症、神经退行性疾病）
• 来自不同动物模型的外泌体（如小鼠、大鼠）
• 来自不同细胞系的外泌体

检测方法

• 超速离心法：利用高速离心分离不同大小颗粒的金标准方法。
• 尺寸排阻色谱法（SEC）：根据分子大小进行分离，能较好保持外泌体生物活性。
• 聚合物沉淀法：利用聚合物（如PEG）使外泌体沉淀，操作简单。
• 免疫亲和捕获法：利用抗体（如抗CD9、CD63、CD81）磁珠特异性抓取外泌体。
• 微流控技术：利用芯片技术实现外泌体的高效分离和检测。
• 纳米颗粒跟踪分析（NTA）：通过光散射和布朗运动测定颗粒粒径和浓度。
• 动态光散射（DLS）：通过测量颗粒的散射光波动来分析粒径分布。
• 透射电子显微镜（TEM）：用于观察外泌体的形态和大小。
• 蛋白质印迹（Western Blot）：用于检测外泌体特异性标志蛋白。
• 酶联免疫吸附测定（ELISA）：定量检测外泌体表面蛋白或携带的抗原。
• 二代测序（NGS）：用于外泌体RNA和DNA甲基化等的高通量测序。
• 全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）：用于全基因组范围内检测DNA甲基化。
• 简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS）：用于富集CpG区域的甲基化测序。
• 甲基化特异性PCR（MSP）：用于检测特定基因位点的甲基化状态。
• 焦磷酸测序（Pyrosequencing）：对短序列进行高精度的甲基化定量。
• 染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）：用于研究外泌体中组蛋白修饰的全基因组分布。
• Cut&Tag：一种用于分析蛋白-DNA相互作用的高灵敏度方法。
• ATAC-seq：用于检测外泌体的染色质可及性。
• qRT-PCR：对特定RNA分子进行绝对或相对定量。
• 微阵列芯片：用于同时检测大量RNA分子的表达水平。
• 质谱分析（MS）：用于鉴定和定量外泌体中的蛋白质和修饰。
• 液相色谱-质谱联用（LC-MS/MS）：用于高精度鉴定复杂样品中的分子。
• 高效液相色谱（HPLC）：用于分离和分析外泌体中的生物分子。
• 流式细胞术（FCM）：用于对外泌体或其捕获 beads 进行多参数分析。

检测仪器

• 超速离心机
• 纳米颗粒跟踪分析仪（NTA）
• 动态光散射仪（DLS）
• 透射电子显微镜（TEM）
• 扫描电子显微镜（SEM）
• 高通量测序仪（Illumina NovaSeq等）
• 实时荧光定量PCR仪（qPCR仪）
• 数字PCR仪（dPCR）
• 焦磷酸测序仪
• 流式细胞仪
• 高效液相色谱仪（HPLC）
• 液相色谱-质谱联用仪（LC-MS/MS）
• 蛋白质印迹系统
• 酶标仪
• 微流控芯片系统