去势模型基因表达实验

信息概要

• 去势模型基因表达实验是研究激素剥夺（如通过手术或化学方式去势）对生物体基因表达谱影响的检测服务，广泛应用于肿瘤学、内分泌学及药物开发领域。
• 该检测通过分析模型（如动物模型或细胞模型）在去势处理后全基因组转录水平的变化，揭示激素调控的关键通路、生物标志物及潜在治疗靶点。
• 检测的重要性在于为癌症（如前列腺癌、乳腺癌）的激素治疗机制研究、耐药性评估以及新型内分泌治疗策略的开发提供关键分子层面的数据支持。

检测项目

• RNA提取质量评估
• RNA浓度与纯度测定
• RNA完整性检测
• cDNA合成效率验证
• 全转录组测序
• mRNA表达定量
• lncRNA表达分析
• circRNA表达检测
• miRNA表达谱分析
• 基因表达差异分析
• 显著性差异基因筛选
• 表达聚类分析
• 共表达网络构建
• GO功能富集分析
• KEGG通路富集分析
• Reactome通路分析
• GSEA基因集富集分析
• 蛋白互作网络分析
• 转录因子调控预测
• 可变剪切事件分析
• 基因融合检测
• SNP/突变关联分析
• 表达稳定性验证
• 内参基因评估
• qPCR验证实验
• 表达热图绘制
• 火山图分析
• 散点图可视化
• 趋势分析
• 生物标志物筛选
• 预后关联模型构建
• 多组学数据整合

检测范围

• 前列腺癌去势抵抗模型
• 乳腺癌卵巢去势模型
• 睾丸切除大鼠模型
• 卵巢切除小鼠模型
• 化学去势药物处理模型
• 激素敏感型细胞系模型
• 激素抵抗型异种移植模型
• 原位去势肿瘤模型
• 转基因去势模型
• 人源化去势模型
• 垂体下调模型
• 肾上腺切除模型
• 下丘脑-垂体-性腺轴模型
• 雌激素受体敲除模型
• 雄激素受体敲除模型
• 芳香化酶抑制剂处理模型
• 抗雄激素药物处理模型
• 抗雌激素药物处理模型
• 促性腺激素释放激素激动剂模型
• 促性腺激素释放激素拮抗剂模型
• 性激素剥夺细胞模型
• 器官oid去势模型
• 患者来源异种移植去势模型
• 循环肿瘤细胞去势模型
• 微小残留病灶模型
• 转移灶去势模型
• 耐药性进化模型
• 激素添加回补实验模型
• 联合治疗响应模型
• 时间序列去势处理模型

检测方法

• TRIzol法 - 经典的酚-氯仿提取RNA方法
• 柱式离心法 - 采用硅胶膜柱进行RNA纯化
• 磁珠法 - 使用磁性颗粒分离RNA
• Agilent 2100 Bioanalyzer - 评估RNA完整性指数
• NanoDrop分光光度法 - 快速测定RNA浓度与纯度
• Illumina测序 - 高通量测序平台进行转录组分析
• RT-qPCR - 实时荧光定量PCR验证基因表达
• 数字PCR - 绝对定量基因表达水平
• 链特异性建库 - 准确区分正义与反义转录本
• polyA富集法 - 选择性检测带polyA尾的RNA
• rRNA去除法 - 去除核糖体RNA进行全转录组分析
• SMART-seq2 - 单细胞全长转录组扩增技术
• DESeq2 - 基于负二项分布的差异表达分析
• edgeR - 用于计数数据的差异表达分析
• limma-voom - 适用于RNA-seq数据的线性模型分析
• WGCNA - 权重基因共表达网络分析
• STAR - 快速准确的RNA-seq序列比对工具
• Hisat2 - 低内存占用的序列比对方法
• StringTie - 转录本组装与定量软件
• Cufflinks - 用于转录本组装与表达量计算
• GATK - 用于RNA-seq变异检测
• Metascape - 进行多组学通路富集分析
• IPA - ingenuity pathway analysis进行通路分析

检测仪器

• Nanodrop分光光度计
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Qubit荧光定量仪
• PCR仪
• 实时荧光定量PCR仪
• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• 低温高速离心机
• 超低温冰箱
• 生物安全柜
• 微孔板读板机
• 自动化液体处理项目合作单位