信息概要
- 细胞空间转录组学实验是一种先进的高通量技术，能够在保留组织空间结构的同时，全面分析细胞中基因的表达谱。
- 该检测服务对于理解细胞异质性、组织微环境、发育生物学及疾病机制（如肿瘤免疫和神经退行性疾病）具有关键作用，为精准医疗和药物研发提供重要依据。
- 我们的服务提供从样本制备、数据采集到生物信息学分析的一站式解决方案，确保数据的准确性和可靠性。
检测项目
- 基因表达定量分析
- 细胞类型鉴定
- 空间基因表达模式分析
- 差异表达基因分析
- 细胞群落识别
- 组织区域分割
- 细胞间通信网络推断
- 配体-受体互作分析
- 基因集富集分析
- 通路活性评分
- 发育轨迹重建
- 细胞状态转换分析
- 空间共表达模块识别
- 细胞空间邻域分析
- 肿瘤微环境表征
- 免疫细胞浸润评估
- 血管生成相关基因表达
- 神经突触基因表达图谱
- 细胞周期阶段评估
- 应激反应基因签名分析
- 细胞代谢状态分析
- 细胞分化状态标记
- 细胞凋亡信号检测
- 炎症反应特征分析
- 细胞外基质成分表达
- 细胞极性基因表达
- 干细胞标志物定位
- 细胞谱系追踪
- 空间变异基因识别
- 细胞空间聚类分析
- 组织层特异性基因鉴定
- 细胞迁移相关基因分析
- 细胞形态与基因表达关联分析
- 多组学数据整合分析
- 自定义生物标志物空间验证
检测范围
需要检测，但不确定项目与标准？工程师为您一对一制定检测方案
- 10x Genomics Visium
- Nanostring GeoMx Digital Spatial Profiler
- Vizgen MERSCOPE
- Akoya Biosciences CODEX
- Replay Sequencing
- Slide-seq
- Seq-Scope
- High-Density Spatial Transcriptomics
- DBiT-seq
- Stereo-seq
- Light-Seq
- Pixel-seq
- Seq-Scope
- SPLiT-seq
- Tomoseq
- FISSEQ
- MERFISH
- seqFISH
- osmFISH
- STARmap
- HybISS
- pciSeq
- ZipSeq
- ExSeq
- BARseq
- SRT-seq
- Proximity ID
- LASSO
- HDST
- Slide-DNA-seq
- Spatial ATAC-seq
- Spatial CUT&Tag
- Spatial Metabolomics
- Spatial Proteomics
- Multimodal Spatial Omics
检测方法
检测报告可以为您解决：产品性能提升改进科研项目立项与结题依据内部科研新品把控生产工艺改进与失效分析
- 基于NGS的空间转录组学：通过高通量测序对带有空间位置信息的cDNA文库进行测序。
- 基于成像的空间转录组学：利用荧光原位杂交或成像测序技术直接在组织原位检测RNA。
- 组织切片制备与优化：确保组织形态完整和RNA质量，是实验成功的前提。
- 组织透化处理：优化条件以释放组织中的RNA并与捕获探针结合。
- 探针杂交与连接：使用带有条形码的探针与目标RNA结合，赋予其空间坐标信息。
- cDNA合成与扩增：将捕获的RNA反转录成cDNA并进行扩增，构建测序文库。
- 文库构建与质检：制备适用于Illumina等平台的测序文库，并进行质量评估。
- 高通量测序：在Illumina NovaSeq等平台上进行深度测序。
- 图像采集与拼接：对切片进行高分辨率成像，并拼接生成完整的空间图像。
- 空间条形码解码：将测序得到的条形码序列与空间位置进行匹配。
- 原始数据预处理：包括碱基识别、质量控制和去噪。
- 序列比对：将测序reads比对到参考基因组。
- 基因表达矩阵生成：统计每个空间点位或细胞上的基因表达量。
- 组织与细胞分割：利用图像分析技术界定组织区域和单个细胞的边界。
- 数据标准化与校正：消除技术噪音和批次效应，使数据可比。
- 无监督聚类分析：识别具有相似表达模式的空间区域或细胞类型。
- 差异表达分析：比较不同区域或条件下的基因表达水平。
- 空间趋势分析：鉴定基因表达在空间上的梯度变化模式。
- 细胞通讯分析：推断基于配体-受体对的细胞间相互作用。
- 多组学数据整合：将空间转录组数据与其它模态数据（如蛋白组）结合分析。
检测仪器
- Illumina NovaSeq 6000测序仪
- 10x Genomics Visium平台
- Nanostring GeoMx DSP
- Vizgen MERSCOPE平台
- Akoya Biosciences PhenoCycler-Fusion
- Leica cryostat冰冻切片机
- Zeiss Axio Scan.Z1全自动扫描显微镜
- Thermo Fisher Scientific Countess II FL自动细胞计数仪
- Agilent 4200 TapeStation系统
- Qubit 4.0荧光计
- Bio-Rad CFX Opus 96实时PCR系统
- Beckman Coulter Biomek i7自动化工作站
- Mission Bio Tapestri平台
- Fluidigm C1系统
- Oxford Nanopore PromethION
机构信息
机构名称：北京中科光析科学技术研究所
简称：中析研究所
单位性质：集体所有制（股份合作）科研检测单位
隶属单位：北京前沿科学技术研究院
机构定位：以科研检测为主的科学技术研究机构；第三方分析测试技术服务单位
资质认可：旗下实验室获得CMA检验检测机构资质认定与CNAS实验室认可
机构荣誉：国家高新技术企业、中关村高新技术企业
检测方针：公正、科学、准确、优质
执业原则：严谨、诚信
经营理念：以客户需求为中心，真正解决顾客难题
服务内容：研发设计、分析检测、试验验证、共性加工、信息及知识产权等
服务行业：航空航天、军工科研、高端制造、新能源与节能环保、石油化工、生物医药、电子信息、新材料研发、汽车及轨道交通、建筑建材等
