临床分离株支原体MLST分型实验

信息概要

临床分离株支原体MLST分型实验是一种基于多位点序列分型技术的检测服务，用于对支原体临床分离株进行准确分型和溯源分析。

该检测服务通过分析多个管家基因的序列变异，为流行病学调查、耐药性监测和感染控制提供科学依据。

MLST分型在支原体感染的临床诊断和公共卫生管理中具有重要意义，能够帮助识别爆发源、追踪传播链以及监测菌株进化。

检测项目

• 支原体种属鉴定
• 多位点序列分型(MLST)
• 管家基因序列分析
• 等位基因谱测定
• 序列型(ST)确定
• 克隆复合体分析
• 种群结构分析
• 遗传多样性评估
• 菌株亲缘关系分析
• 流行病学关联研究
• 耐药基因筛查
• 毒力因子检测
• 基因组变异分析
• 单核苷酸多态性(SNP)分析
• 重组事件检测
• 选择压力分析
• 分子钟分析
• 地理分布研究
• 宿主适应性分析
• 传播动力学建模

检测范围

• 肺炎支原体
• 生殖支原体
• 人型支原体
• 口腔支原体
• 发酵支原体
• 穿透支原体
• 梨支原体
• 猪鼻支原体
• 鸡毒支原体
• 猪肺炎支原体
• 牛支原体
• 山羊支原体
• 绵羊支原体
• 禽支原体
• 鼠支原体
• 犬支原体
• 猫支原体
• 马支原体
• 兔支原体
• 鱼支原体

检测方法

• PCR扩增 - 用于靶基因的特异性扩增
• Sanger测序 - 进行基因序列的准确测定
• 毛细管电泳 - 用于PCR产物的分离和检测
• 生物信息学分析 - 对测序数据进行处理和分析
• 多位点序列比对 - 比较不同菌株的基因序列
• 系统发育分析 - 构建菌株间的进化关系
• 等位基因分配 - 确定每个位点的等位基因型
• 序列型确定 - 根据等位基因谱确定ST型
• eBURST分析 - 用于克隆复合体的识别
• MLST数据库查询 - 比对已知的序列型
• SNP检测 - 识别单核苷酸变异
• 重组检测 - 分析基因组重组事件
• 选择压力分析 - 评估基因的选择压力
• 分子钟分析 - 估算菌株分化时间
• 群体遗传学分析 - 研究菌株群体结构

检测仪器

• PCR仪
• 核酸提取仪
• 电泳仪
• 毛细管电泳系统
• DNA测序仪
• 微量分光光度计
• 荧光定量PCR仪
• 凝胶成像系统
• 超纯水系统
• 生物安全柜
• 恒温培养箱
• 离心机
• 涡旋混合器
• 微量加样器
• 核酸浓度测定仪