小鼠心脏表观组学检测

信息概要

小鼠心脏表观组学检测是一种针对小鼠心脏组织的表观遗传学分析服务，通过高通量技术全面解析DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性等表观遗传特征。该检测可揭示心脏发育、疾病机制及药物响应的表观调控网络，为心血管研究提供分子层面的数据支持。

表观组学检测的重要性在于，它能够在不改变DNA序列的情况下，揭示基因表达的调控机制，帮助研究者理解心脏疾病的发病机理、筛选潜在生物标志物，并为精准治疗提供理论依据。

检测项目

• 全基因组DNA甲基化分析
• 启动子区甲基化水平检测
• CpG岛甲基化状态评估
• 组蛋白H3K4me3修饰检测
• 组蛋白H3K27ac修饰分析
• 组蛋白H3K9me3修饰定量
• 染色质开放区域测序（ATAC-seq）
• 染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）
• 非编码RNA表达谱分析
• 环状RNA表达量检测
• 长链非编码RNA（lncRNA）表达分析
• 微小RNA（miRNA）表达谱检测
• 转录因子结合位点分析
• 增强子活性检测
• 绝缘子元件功能评估
• 核小体定位分析
• 三维基因组结构检测（Hi-C）
• 等位基因特异性甲基化分析
• 差异甲基化区域（DMR）鉴定
• 表观遗传时钟分析

检测范围

• DNA甲基化检测
• 组蛋白修饰分析
• 染色质可及性检测
• 非编码RNA分析
• 转录因子结合分析
• 增强子活性检测
• 绝缘子元件分析
• 核小体定位
• 三维基因组结构
• 等位基因特异性表观遗传
• 表观遗传时钟
• 单细胞表观组学
• 空间表观组学
• 多组学整合分析
• 表观遗传药物筛选
• 心脏发育表观调控
• 心脏疾病表观标志物
• 心脏衰老表观特征
• 心脏再生表观机制
• 心脏代谢表观调控

检测方法

• 亚硫酸氢盐测序（BS-seq）：用于全基因组DNA甲基化分析
• 简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS）：针对CpG富集区域的甲基化检测
• 甲基化DNA免疫共沉淀测序（MeDIP-seq）：通过抗体富集甲基化DNA片段
• 染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）：分析特定组蛋白修饰或转录因子结合位点
• 转座酶可及染色质测序（ATAC-seq）：检测染色质开放区域
• 高通量染色体构象捕获（Hi-C）：研究三维基因组结构
• 单细胞ATAC-seq：在单细胞水平分析染色质可及性
• 单细胞甲基化测序：单细胞分辨率的DNA甲基化分析
• 纳米孔测序：实时检测DNA甲基化修饰
• 甲基化特异性PCR（MSP）：针对特定基因的甲基化状态检测
• 焦磷酸测序：定量分析特定CpG位点的甲基化水平
• 微阵列分析：使用芯片技术检测表观遗传标记
• 质谱法：准确测定组蛋白修饰的化学组成
• Western blot：半定量分析组蛋白修饰水平
• 免疫荧光：可视化特定表观标记的空间分布

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000测序仪
• Illumina HiSeq X Ten测序仪
• PacBio Sequel II测序系统
• Oxford Nanopore PromethION
• Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Qubit荧光定量仪
• Nanodrop分光光度计
• Covaris超声破碎仪
• Bio-Rad CFX96实时荧光定量PCR仪
• Applied Biosystems 7500实时PCR系统
• Beckman Coulter CytoFLEX流式细胞仪
• Zeiss LSM 880激光共聚焦显微镜
• Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos质谱仪
• BioTek Synergy H1微孔板检测仪