脑脊液微生物宏基因组检测

信息概要

脑脊液微生物宏基因组检测是一种通过高通量测序技术，对脑脊液样本中的微生物基因组进行全面分析的检测服务。该检测能够快速、准确地识别脑脊液中的细菌、病毒、真菌、寄生虫等病原体，为中枢神经系统感染的诊断和治疗提供重要依据。

该检测的重要性在于，中枢神经系统感染病情复杂且进展迅速，传统检测方法如培养、PCR等存在灵敏度低、耗时长或检测范围窄的局限性。而宏基因组检测无需培养，直接对样本中的核酸进行测序，能够覆盖更广泛的病原体，尤其适用于疑难、罕见或混合感染的诊断。

本检测服务由第三方检测机构提供，具备标准化实验流程、严格的质量控制和生物信息学分析能力，可帮助临床医生快速明确病因，指导精准用药，改善患者预后。

检测项目

• 细菌基因组检测
• 病毒基因组检测
• 真菌基因组检测
• 寄生虫基因组检测
• 结核分支杆菌复合群检测
• 隐球菌检测
• 单纯疱疹病毒检测
• 肠道病毒检测
• 巨细胞病毒检测
• EB病毒检测
• 弓形虫检测
• 梅毒螺旋体检测
• 李斯特菌检测
• 肺炎链球菌检测
• 脑膜炎奈瑟菌检测
• 流感嗜血杆菌检测
• 新型隐球菌检测
• 白色念珠菌检测
• 曲霉菌检测
• 诺卡菌检测

检测范围

• 细菌感染检测
• 病毒感染检测
• 真菌感染检测
• 寄生虫感染检测
• 结核性脑膜炎检测
• 病毒性脑炎检测
• 化脓性脑膜炎检测
• 隐球菌性脑膜炎检测
• 神经梅毒检测
• 莱姆病神经表现检测
• 艾滋病相关中枢神经系统感染检测
• 移植后中枢神经系统感染检测
• 肿瘤相关中枢神经系统感染检测
• 新生儿中枢神经系统感染检测
• 术后中枢神经系统感染检测
• 不明原因发热伴神经系统症状检测
• 脑脓肿病原体检测
• 脊髓炎病原体检测
• 脑室炎病原体检测
• 混合感染病原体检测

检测方法

• 高通量测序：采用下一代测序技术对样本中所有微生物核酸进行测序
• DNA提取：使用磁珠法或柱提法提取样本中的微生物DNA
• RNA反转录：对RNA病毒基因组进行反转录处理
• 文库构建：将核酸片段连接测序接头，构建测序文库
• 质量控制：对提取的核酸和构建的文库进行质量评估
• 测序：在Illumina等平台上进行高通量测序
• 数据过滤：去除低质量和宿主来源的序列
• 序列比对：将测序reads与微生物参考基因组比对
• 物种注释：基于序列相似性鉴定微生物种类
• 丰度分析：计算各微生物的相对含量
• 耐药基因分析：检测病原体携带的耐药基因
• 毒力因子分析：鉴定病原体的毒力相关基因
• 新病原体筛查：通过de novo组装识别未知微生物
• 统计学分析：评估检测结果的统计学显著性
• 报告生成：整合分析结果，生成临床可解读的报告

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina NextSeq 550
• Illumina MiSeq
• Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
• Oxford Nanopore GridION
• Oxford Nanopore MinION
• PacBio Sequel II
• Qubit荧光定量仪
• Agilent 2100生物分析仪
• Nanodrop分光光度计
• PCR仪
• 核酸提取仪
• 离心机
• 超低温冰箱
• 生物安全柜