微生物检测多位点序列分型

信息概要

微生物检测多位点序列分型（MLST）是一种基于多位点基因序列分析的分子分型技术，通过对多个保守基因位点进行测序和比对，实现对微生物菌株的高分辨率分型和溯源。

该检测服务广泛应用于临床诊断、流行病学调查、食品安全监测及环境微生物研究等领域，为病原体鉴定、传播链追踪和耐药性分析提供科学依据。

检测结果具有高度重复性和可比性，是国际通用的标准化分型方法。

检测项目

• 16S rRNA基因测序
• 管家基因序列分析
• 等位基因谱测定
• 序列型(ST)鉴定
• 克隆复合体(CC)分析
• 多位点变异检测
• 单核苷酸多态性(SNP)分析
• 基因座保守性评估
• 菌株亲缘关系树构建
• 种群遗传多样性分析
• 耐药基因关联研究
• 毒力基因筛查
• 环境适应性基因检测
• 水平基因转移分析
• 菌株地理分布溯源
• 爆发菌株分子特征比对
• 实验室交叉污染鉴定
• 微生物群落优势菌分型
• 基因重组事件检测
• 进化速率计算

检测范围

• 革兰氏阳性细菌
• 革兰氏阴性细菌
• 酵母样真菌
• 丝状真菌
• 放线菌
• 支原体
• 衣原体
• 立克次体
• 螺旋体
• 厌氧菌
• 嗜热菌
• 极端环境微生物
• 病原性大肠杆菌
• 金黄色葡萄球菌
• 沙门氏菌
• 李斯特菌
• 结核分支杆菌
• 军团菌
• 弧菌属
• 链球菌

检测方法

• PCR扩增：靶向扩增特定基因片段
• Sanger测序：传统毛细管电泳测序技术
• 二代测序：高通量平行测序平台
• 生物信息学分析：序列拼接和比对
• 等位基因分配：根据数据库标准命名
• 最小生成树分析：显示菌株进化关系
• BLAST比对：序列相似性检索
• 多位点联合分析：综合多个基因位点数据
• 基因型聚类：基于遗传距离分组
• 重组检测：识别基因重组事件
• 选择压力分析：评估基因进化选择
• 系统发育分析：构建进化树模型
• 全基因组关联研究：结合表型数据分析
• 机器学习分类：利用算法预测菌株特征
• 质控验证：确保数据准确性和重复性

检测仪器

• PCR仪
• 电泳仪
• 毛细管电泳系统
• 二代测序仪
• 纳米孔测序仪
• 荧光定量PCR仪
• 核酸提取仪
• 超微量分光光度计
• 凝胶成像系统
• 生物分析仪
• 高速离心机
• 恒温金属浴
• 超纯水系统
• 生物安全柜
• 低温冰箱