金黄色葡萄球菌MLST分型测试

信息概要

金黄色葡萄球菌MLST分型测试是一种基于多位点序列分型技术的检测服务，用于对金黄色葡萄球菌进行准确的基因分型和溯源分析。

该检测通过分析多个保守基因位点的序列变异，能够准确区分不同菌株的遗传背景，为流行病学调查、耐药性监测和感染控制提供重要依据。

金黄色葡萄球菌是医院感染和社区获得性感染的重要病原体，其MLST分型检测对于追踪传染源、识别暴发菌株以及制定防控策略具有重要意义。

检测项目

• arcC基因序列分析
• aroE基因序列分析
• glpF基因序列分析
• gmk基因序列分析
• pta基因序列分析
• tpi基因序列分析
• yqiL基因序列分析
• ST型别鉴定
• CC型别鉴定
• 等位基因谱分析
• 菌株亲缘关系分析
• 流行克隆群鉴定
• 耐药基因关联分析
• 毒力基因检测
• 基因组多态性分析
• 菌株溯源追踪
• 暴发菌株识别
• 进化关系分析
• 基因重组事件检测
• 菌株传播路径分析

检测范围

• 临床分离金黄色葡萄球菌
• 环境样本金黄色葡萄球菌
• 食品污染金黄色葡萄球菌
• 动物源金黄色葡萄球菌
• 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)
• 社区获得性金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)
• 医院获得性金黄色葡萄球菌(HA-MRSA)
• 产毒金黄色葡萄球菌
• 耐万古霉素金黄色葡萄球菌(VRSA)
• 耐多药金黄色葡萄球菌(MDR-SA)
• 皮肤软组织感染金黄色葡萄球菌
• 血流感染金黄色葡萄球菌
• 呼吸道感染金黄色葡萄球菌
• 骨关节感染金黄色葡萄球菌
• 心内膜炎相关金黄色葡萄球菌
• 新生儿感染金黄色葡萄球菌
• 乳腺炎相关金黄色葡萄球菌
• 食源性疾病金黄色葡萄球菌
• 生物膜形成金黄色葡萄球菌
• 小菌落变异体金黄色葡萄球菌(SCV)

检测方法

• PCR扩增 - 用于目标基因片段的特异性扩增
• Sanger测序 - 对PCR产物进行双向序列测定
• 毛细管电泳 - 用于测序片段的分离和检测
• 序列比对 - 将测序结果与数据库进行比对分析
• 等位基因分配 - 根据序列变异确定等位基因型
• ST型别判定 - 综合多个位点的等位基因谱确定ST型
• CC型分析 - 基于ST型进行克隆复合群划分
• 系统发育分析 - 构建菌株间的进化关系树
• 多位点变异分析 - 检测多个位点的序列多态性
• 基因重组检测 - 分析可能的基因重组事件
• 序列质量控制 - 确保测序数据的准确性和可靠性
• 数据库比对 - 与国际MLST数据库进行比对
• 菌株聚类分析 - 基于遗传相似性进行菌株分组
• 最小生成树分析 - 展示菌株间的遗传关联
• 流行病学关联分析 - 评估菌株间的传播关系

检测仪器

• PCR仪
• 核酸提取仪
• 电泳仪
• 毛细管电泳仪
• 测序仪
• 微量分光光度计
• 核酸定量仪
• 生物分析仪
• 离心机
• 超净工作台
• 生物安全柜
• 恒温培养箱
• 振荡器
• 冷冻离心机
• 超低温冰箱