小RNA测序文库测试

信息概要

小RNA测序文库测试是一种基于高通量测序技术的检测服务，专注于对小RNA分子进行精准分析和鉴定。小RNA（如miRNA、siRNA、piRNA等）在基因表达调控、细胞分化、疾病发生等生物学过程中发挥重要作用。通过小RNA测序文库测试，可以全面解析样本中小RNA的种类、表达水平及功能，为科研和临床诊断提供关键数据支持。

该检测服务的重要性在于能够揭示小RNA在疾病标志物筛选、药物靶点发现以及遗传调控机制研究中的潜在价值。高质量的测序文库构建和数据分析是确保结果准确性的核心环节，因此选择的第三方检测机构至关重要。

检测项目

• 小RNA总量测定
• RNA完整性检测
• miRNA表达谱分析
• siRNA鉴定与定量
• piRNA筛选与注释
• 小RNA长度分布分析
• 序列比对与注释
• 差异表达分析
• 靶基因预测
• 功能富集分析
• novel miRNA预测
• SNP/突变检测
• 甲基化修饰分析
• 样本间相关性分析
• 聚类分析
• 通路分析
• 共表达网络构建
• 生物学重复性评估
• 数据可视化报告
• 原始数据质控

检测范围

• 动物组织小RNA
• 植物组织小RNA
• 血液样本小RNA
• 细胞系小RNA
• 外泌体小RNA
• 微生物小RNA
• 病毒小RNA
• 血清/血浆小RNA
• 脑脊液小RNA
• 尿液小RNA
• 唾液小RNA
• 粪便小RNA
• 肿瘤组织小RNA
• 胚胎组织小RNA
• 干细胞小RNA
• 免疫细胞小RNA
• 神经细胞小RNA
• 生殖细胞小RNA
• 病原体感染样本小RNA
• 环境样本小RNA

检测方法

• TRIzol法RNA提取：用于从复杂样本中分离总RNA
• Agilent 2100 Bioanalyzer检测：评估RNA完整性
• Small RNA文库构建：采用接头连接和逆转录步骤
• PCR扩增：富集小RNA片段
• Illumina测序：高通量测序平台进行序列读取
• FastQC质控：原始数据质量评估
• Cutadapt修剪：去除接头序列
• Bowtie比对：序列与参考基因组比对
• miRDeep2分析：novel miRNA预测
• DESeq2差异分析：统计显著性评估
• GO富集分析：功能注释
• KEGG通路分析：生物学通路映射
• qRT-PCR验证：关键miRNA表达验证
• Northern Blot：特定小RNA检测
• 纳米颗粒跟踪分析：外泌体小RNA分离

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Qubit Fluorometer
• Nanodrop spectrophotometer
• Thermal cycler
• Centrifuge
• Vortex mixer
• Electrophoresis system
• Real-time PCR system
• Nanopore MinION
• Pippin Prep
• Covaris sonicator
• Magnetic stand
• Hybridization oven
• Microarray scanner