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转录组测序质量检测

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信息概要

转录组测序质量检测是一项关键的生物信息学服务,旨在评估RNA测序数据的质量、完整性和可靠性。该检测服务适用于科研机构、医疗机构和生物技术公司,确保测序数据符合后续分析的要求。高质量的转录组数据是基因表达分析、差异表达研究和功能基因组学研究的基础,因此质量检测在实验设计和数据分析中具有重要作用。

本检测服务涵盖多个关键参数,包括测序深度、覆盖度、碱基质量、序列污染等,确保数据准确性和可重复性。通过的第三方检测,用户可以及时发现测序过程中的问题,优化实验方案,提高研究效率。

检测项目

  • 总RNA完整性检测
  • RNA浓度测定
  • RNA纯度检测
  • 测序文库浓度测定
  • 测序文库片段分布
  • 测序数据产量统计
  • 测序数据质量值分布
  • 测序数据碱基组成分析
  • 测序数据GC含量分析
  • 测序数据重复序列比例
  • 测序数据比对率
  • 基因覆盖均匀性检测
  • 测序数据3'端偏好性分析
  • 测序数据5'端偏好性分析
  • 外源污染检测
  • rRNA残留比例检测
  • 测序数据错误率分析
  • 测序数据插入片段大小分析
  • 测序数据链特异性检测
  • 测序数据拼接完整性评估

检测范围

  • mRNA测序
  • small RNA测序
  • lncRNA测序
  • circRNA测序
  • 全转录组测序
  • 单细胞转录组测序
  • 空间转录组测序
  • 微生物转录组测序
  • 植物转录组测序
  • 动物转录组测序
  • 人类转录组测序
  • 病毒转录组测序
  • 肿瘤转录组测序
  • 免疫转录组测序
  • 发育转录组测序
  • 环境转录组测序
  • 代谢转录组测序
  • 表观转录组测序
  • 核糖体测序
  • 外显子测序

检测方法

  • Agilent Bioanalyzer检测:评估RNA完整性和片段分布
  • Nanodrop分光光度法:测定RNA浓度和纯度
  • Qubit荧光定量法:准确测定核酸浓度
  • RT-qPCR:检测特定RNA序列的完整性
  • Illumina测序平台质控:评估原始测序数据质量
  • FastQC分析:检测测序数据的碱基质量和组成
  • Bowtie/TopHat比对:评估测序数据比对率
  • Picard工具分析:检测测序数据重复率和覆盖度
  • RSeQC分析:评估测序数据的链特异性和偏好性
  • Kraken分析:检测外源微生物污染
  • RNA-SeQC分析:综合评估转录组测序质量
  • Salmon定量分析:评估基因表达量的准确性
  • MultiQC整合分析:汇总多个质控指标
  • Blast比对:检测可能的序列污染
  • GC含量分析:评估测序数据的GC分布

检测仪器

  • Agilent 2100 Bioanalyzer
  • Nanodrop分光光度计
  • Qubit荧光定量仪
  • Illumina NovaSeq测序仪
  • Illumina HiSeq测序仪
  • Illumina MiSeq测序仪
  • Thermo Fisher QuantStudio实时荧光定量PCR仪
  • Bio-Rad CFX Connect实时荧光定量PCR仪
  • Covaris超声破碎仪
  • Beckman Coulter超速离心机
  • Eppendorf离心机
  • Thermo Fisher PCR仪
  • Labconco超纯水系统
  • BioTek酶标仪
  • Thermo Fisher Nanodrop One

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试。

以上是关于转录组测序质量检测的相关介绍,如有其他疑问可以咨询在线工程师为您服务。

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